155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2330 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  780    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  53.96 
 
 
403 aa  347  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  49.22 
 
 
393 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  46.13 
 
 
424 aa  323  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  44.21 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  43.95 
 
 
388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  42.96 
 
 
394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  44.96 
 
 
386 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  44.87 
 
 
396 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  48.06 
 
 
391 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  44.62 
 
 
396 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  43.12 
 
 
393 aa  293  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  46.86 
 
 
384 aa  289  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  47.68 
 
 
397 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  44.09 
 
 
394 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  44.69 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  44.17 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  44.3 
 
 
396 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  43.85 
 
 
397 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  43.26 
 
 
396 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  44.71 
 
 
386 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  44.82 
 
 
397 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  44.3 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  44.3 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  43.15 
 
 
397 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  44.44 
 
 
396 aa  272  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  47.07 
 
 
398 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  45.77 
 
 
398 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  43.38 
 
 
410 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  43.55 
 
 
397 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  44.04 
 
 
396 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  44.33 
 
 
400 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  43.26 
 
 
410 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  43.26 
 
 
410 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  43.01 
 
 
396 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  43.01 
 
 
396 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  43.01 
 
 
396 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  43.01 
 
 
396 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  43.01 
 
 
396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  39.56 
 
 
370 aa  259  7e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  39.29 
 
 
370 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  40.68 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  39.63 
 
 
360 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  33.76 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  34.54 
 
 
395 aa  219  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  41.24 
 
 
404 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  37.82 
 
 
394 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  40.26 
 
 
366 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  40.7 
 
 
376 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  39.79 
 
 
358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  39.74 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  37.76 
 
 
368 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  34.45 
 
 
375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  39.01 
 
 
369 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  37.5 
 
 
375 aa  193  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  37.5 
 
 
451 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  38.82 
 
 
337 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  35.08 
 
 
398 aa  180  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  34.4 
 
 
393 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  28.03 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  33.93 
 
 
387 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  35.1 
 
 
394 aa  162  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  32.72 
 
 
386 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  32.44 
 
 
386 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  34.92 
 
 
384 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  31.82 
 
 
397 aa  156  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  32.21 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  33.33 
 
 
377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  31.25 
 
 
385 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  31.4 
 
 
385 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  33 
 
 
377 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  30.69 
 
 
385 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  31.55 
 
 
378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  31.21 
 
 
410 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  34.17 
 
 
387 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  30.13 
 
 
386 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  34.24 
 
 
358 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.79 
 
 
370 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  27.7 
 
 
400 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  34.44 
 
 
357 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  26.82 
 
 
400 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  34.16 
 
 
392 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15581  hypothetical protein  31.81 
 
 
405 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.540295 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  29.04 
 
 
401 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  32.86 
 
 
363 aa  123  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  29.95 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  35.03 
 
 
356 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  32.19 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  26.27 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  30.29 
 
 
365 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  25.32 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  24.19 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  30.03 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  25.32 
 
 
370 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  23.87 
 
 
370 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  30.03 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  25.08 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  31 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  31.37 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  25.36 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>