208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2320 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2320  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 306 aa  620  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216124  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  64.98 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  62.25 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  61.59 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  60.86 
 
 		 323 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  63.3 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  61.26 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  61.26 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  61.26 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  61.26 
 
 		 302 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  59.93 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  61.26 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  60.6 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  60.93 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  60.93 
 
 		 302 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  63.3 
 
 		 304 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  59.93 
 
 		 303 aa  385  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  60.88 
 
 		 305 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  59.67 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  60.13 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  61.9 
 
 		 304 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 		 307 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  59.27 
 
 		 304 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  62.5 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  60.27 
 
 		 304 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  60.61 
 
 		 310 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  62.5 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  61.28 
 
 		 308 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  62.5 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  59.67 
 
 		 310 aa  374  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  61.41 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  62.16 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  60.94 
 
 		 304 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00220  coproporphyrinogen III oxidase  62.21 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  59.93 
 
 		 312 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  60.54 
 
 		 304 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  59.93 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  62.16 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 		 305 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 		 305 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  62.16 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  62.16 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  60.4 
 
 		 311 aa  367  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  59.2 
 
 		 305 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  59.26 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  61.49 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  59.93 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  60.27 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  59.93 
 
 		 303 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  58.92 
 
 		 304 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  59.93 
 
 		 303 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002066  coproporphyrinogen III oxidase aerobic  59.93 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0273  coproporphyrinogen III oxidase  59.2 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  59.33 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  54.9 
 
 		 311 aa  363  1e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  59.6 
 
 		 307 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  54.9 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  62.5 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1921  coproporphyrinogen III oxidase  59.2 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0674331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  58.61 
 
 		 309 aa  363  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  58.61 
 
 		 309 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  59.8 
 
 		 299 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  59.8 
 
 		 299 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  58.61 
 
 		 309 aa  362  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  59.8 
 
 		 299 aa  361  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  59.8 
 
 		 299 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2696  coproporphyrinogen III oxidase  57.68 
 
 		 333 aa  361  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  56.9 
 
 		 312 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  59.46 
 
 		 299 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  60.33 
 
 		 298 aa  358  5e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  60.67 
 
 		 299 aa  358  9e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2634  coproporphyrinogen III oxidase  62.25 
 
 		 304 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0385786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0017  coproporphyrinogen III oxidase  55.66 
 
 		 323 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0061  coproporphyrinogen III oxidase  57.05 
 
 		 314 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0409  coproporphyrinogen III oxidase  55.77 
 
 		 332 aa  352  4e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0203114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0243  coproporphyrinogen III oxidase  53.72 
 
 		 336 aa  348  9e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571977  normal  0.975295 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0017  coproporphyrinogen III oxidase  59.67 
 
 		 305 aa  346  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0015  coproporphyrinogen III oxidase  58.17 
 
 		 331 aa  346  2e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.91658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0783  coproporphyrinogen III oxidase  57 
 
 		 303 aa  345  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696662  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0219  coproporphyrinogen III oxidase  53.12 
 
 		 336 aa  342  4e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3669  coproporphyrinogen III oxidase  57.29 
 
 		 298 aa  341  9e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  57.82 
 
 		 303 aa  339  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  55.16 
 
 		 323 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  52.92 
 
 		 343 aa  338  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  55.16 
 
 		 323 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  56.25 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  55.81 
 
 		 306 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  55.81 
 
 		 306 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3201  coproporphyrinogen III oxidase  55.31 
 
 		 323 aa  338  9e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.182007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  54.84 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1383  coproporphyrinogen III oxidase  54.52 
 
 		 326 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  54.52 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2390  coproporphyrinogen III oxidase  56.48 
 
 		 302 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.967494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1229  coproporphyrinogen III oxidase  54.52 
 
 		 307 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1238  coproporphyrinogen III oxidase  54.52 
 
 		 307 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1886  coproporphyrinogen III oxidase  54.52 
 
 		 307 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.668105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  52.91 
 
 		 345 aa  335  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1073  coproporphyrinogen III oxidase  54.52 
 
 		 307 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0794  coproporphyrinogen III oxidase  54.52 
 
 		 307 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0356  coproporphyrinogen III oxidase  54.52 
 
 		 307 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.791354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>