More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2289 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  100 
 
 
320 aa  662    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  78.03 
 
 
319 aa  527  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  73.55 
 
 
317 aa  484  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  72.35 
 
 
352 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  68.89 
 
 
319 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  68.69 
 
 
319 aa  472  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  68.89 
 
 
320 aa  464  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  68.89 
 
 
320 aa  464  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  68.89 
 
 
320 aa  464  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  71.34 
 
 
316 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  68.24 
 
 
320 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  68.24 
 
 
320 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  69.65 
 
 
320 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  68.24 
 
 
320 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  68.24 
 
 
320 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  70.38 
 
 
316 aa  462  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  69.43 
 
 
317 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  68.77 
 
 
316 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  68.05 
 
 
317 aa  461  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  68.91 
 
 
319 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  69.21 
 
 
320 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  66.25 
 
 
320 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  68.91 
 
 
319 aa  457  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  68.25 
 
 
321 aa  454  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  68.25 
 
 
321 aa  454  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  67.95 
 
 
316 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  68.25 
 
 
321 aa  454  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  67.71 
 
 
321 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  66.46 
 
 
345 aa  454  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
316 aa  454  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  68.25 
 
 
321 aa  454  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2124  thioredoxin reductase  67.31 
 
 
316 aa  454  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000128654  normal  0.0108632 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  68.25 
 
 
321 aa  454  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  68.06 
 
 
316 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  69.55 
 
 
317 aa  454  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  68.25 
 
 
321 aa  454  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  67.31 
 
 
316 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  68.25 
 
 
321 aa  454  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  67.52 
 
 
316 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  68.06 
 
 
316 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  68.25 
 
 
321 aa  454  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  68.45 
 
 
316 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  69.13 
 
 
316 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  68.25 
 
 
322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  66.13 
 
 
316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  66.13 
 
 
316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  68.25 
 
 
321 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  67.09 
 
 
316 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  67.95 
 
 
320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  68.27 
 
 
320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  68.27 
 
 
320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  68.25 
 
 
322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  67.95 
 
 
320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  68.25 
 
 
322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  68.25 
 
 
322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  68.27 
 
 
346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  67.95 
 
 
320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  68.25 
 
 
322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  68.39 
 
 
315 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  66.98 
 
 
317 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  66.35 
 
 
320 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  66.35 
 
 
320 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  65.08 
 
 
320 aa  450  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  66.35 
 
 
320 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  66.35 
 
 
320 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  65.52 
 
 
333 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
320 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  66.35 
 
 
320 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  65.08 
 
 
320 aa  450  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  66.35 
 
 
320 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
323 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  66.77 
 
 
333 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  67.09 
 
 
317 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  66.35 
 
 
320 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  66.03 
 
 
317 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  66.03 
 
 
317 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1932  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
317 aa  448  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  66.03 
 
 
317 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  66.35 
 
 
320 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  67.63 
 
 
317 aa  448  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  68.39 
 
 
318 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  68.98 
 
 
310 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  67.09 
 
 
319 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  66.35 
 
 
342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  65.38 
 
 
317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  67.63 
 
 
346 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  67.63 
 
 
320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  67.1 
 
 
314 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  68.81 
 
 
316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2326  thioredoxin reductase  65.38 
 
 
317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000028573  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  67.63 
 
 
320 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  65.38 
 
 
317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  66.98 
 
 
322 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  65.38 
 
 
317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0689  thioredoxin reductase  65.81 
 
 
318 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.200381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  66.03 
 
 
317 aa  441  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  65.82 
 
 
333 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2209  thioredoxin reductase  66.24 
 
 
316 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.247616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>