More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2287 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  57.32 
 
 		 583 aa  643    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 564 aa  1150    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  40.91 
 
 		 564 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  41.32 
 
 		 564 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  41.18 
 
 		 563 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1436  TrkA-N domain protein  39.75 
 
 		 614 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  37.7 
 
 		 575 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2004  TrkA-N domain protein  36.62 
 
 		 579 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.88767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  37.41 
 
 		 546 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2252  TrkA-N domain protein  35.65 
 
 		 607 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000542956  normal  0.119281 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0076  TrkA-N domain protein  27.59 
 
 		 562 aa  292  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03220  K+ transport system, NAD-binding component  31.94 
 
 		 650 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  27.17 
 
 		 351 aa  97.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  31.29 
 
 		 350 aa  90.5  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  24.61 
 
 		 355 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  27 
 
 		 345 aa  86.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  33.57 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  25.74 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  30.2 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  30.2 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  34.72 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  28.11 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  26.6 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  25.29 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  27.8 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.2 
 
 		 332 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  29.96 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  29.12 
 
 		 352 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.38 
 
 		 347 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  26.22 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.89 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  22.57 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.02 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  31.25 
 
 		 337 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  34.11 
 
 		 325 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  24.9 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  25.17 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.2 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  28.11 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  23.61 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  27.04 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  27.04 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  27.98 
 
 		 368 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 355 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  27.04 
 
 		 351 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 		 350 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  27.04 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  27.36 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  25.4 
 
 		 335 aa  72  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.21 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  24.66 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  26 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  27.9 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  25.48 
 
 		 368 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25.6 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  26.47 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  25.63 
 
 		 366 aa  70.1  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  26.97 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  31.89 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  27.44 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.89 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  27.44 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  25.94 
 
 		 330 aa  67  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  20.14 
 
 		 335 aa  66.6  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  24.32 
 
 		 369 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  27.94 
 
 		 395 aa  66.6  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 		 564 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  27.27 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  24.32 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  24.5 
 
 		 660 aa  65.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  24.32 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  24.32 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  27.23 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  24.81 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  24.4 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  24.4 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  28.77 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  24.4 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  24.4 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  25.39 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.42 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  26.96 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  24.39 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  24.58 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  25.38 
 
 		 337 aa  63.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  24.69 
 
 		 337 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 661 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  25.11 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  25.86 
 
 		 346 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  23.66 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 		 568 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.484589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>