More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2226 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0423  aspartyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 
610 aa  748  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  9.68757e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 
591 aa  761  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.82007e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  66.55 
 
 
591 aa  823  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  62.22 
 
 
592 aa  769  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 
590 aa  737  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
592 aa  646  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.9189e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  60.97 
 
 
599 aa  759  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 
627 aa  659  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 
600 aa  670  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 
593 aa  646  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.00775e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  66.39 
 
 
591 aa  816  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 
596 aa  773  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 
590 aa  743  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 
598 aa  740  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  64.47 
 
 
599 aa  789  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 
592 aa  765  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.41226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2040  aspartyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 
592 aa  765  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00291501  hitchhiker  1.15872e-07 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  68.57 
 
 
590 aa  834  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
590 aa  822  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.46204e-05  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  63.89 
 
 
601 aa  806  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.25703e-08  unclonable  1.15783e-09 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 
592 aa  762  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  62.86 
 
 
600 aa  763  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  62.86 
 
 
600 aa  763  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  61.47 
 
 
605 aa  748  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 
604 aa  725  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
610 aa  635  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  70.46 
 
 
599 aa  867  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  4.68378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0699  aspartyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 
592 aa  734  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1843  aspartyl-tRNA synthetase  62.74 
 
 
591 aa  768  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.986528  normal  0.35056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  67.9 
 
 
591 aa  830  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 
601 aa  727  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 
603 aa  734  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  62.86 
 
 
600 aa  763  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 
604 aa  720  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  62.69 
 
 
600 aa  761  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2038  aspartyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 
592 aa  763  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  62.86 
 
 
600 aa  763  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  63.03 
 
 
599 aa  751  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
590 aa  667  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.46901e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  74.03 
 
 
592 aa  902  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0803  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 
603 aa  734  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.979885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
617 aa  1250  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  61.62 
 
 
591 aa  772  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
583 aa  688  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0999  aspartyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 
589 aa  650  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0326793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  61.85 
 
 
600 aa  750  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 
600 aa  749  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  61.6 
 
 
598 aa  752  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44023e-06 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1108  aspartyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 
589 aa  649  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000320329  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  61.85 
 
 
600 aa  750  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2575  aspartyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 
595 aa  762  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.63507e-05  hitchhiker  0.000702641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 
591 aa  807  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  62.18 
 
 
599 aa  758  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 
590 aa  746  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 
590 aa  746  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 
590 aa  746  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
598 aa  644  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  2.05655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
602 aa  642  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 
585 aa  660  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01552  aspartyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 
588 aa  663  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  61.2 
 
 
623 aa  760  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  63.7 
 
 
599 aa  775  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 
590 aa  740  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 
590 aa  740  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  65.98 
 
 
586 aa  803  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 
590 aa  740  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 
596 aa  773  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  2.41419e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 
597 aa  653  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  4.45499e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 
597 aa  758  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 
593 aa  737  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 
595 aa  754  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 
590 aa  740  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 
590 aa  739  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01597  aspartyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 
592 aa  735  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 
590 aa  746  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 
590 aa  744  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 
592 aa  763  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  6.67018e-05  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 
598 aa  740  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  66.05 
 
 
591 aa  811  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
592 aa  635  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 
598 aa  740  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1751  aspartyl-tRNA synthetase  60.78 
 
 
590 aa  746  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.2582e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  61.85 
 
 
600 aa  752  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
593 aa  647  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.05553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 
600 aa  734  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1886  aspartyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 
591 aa  727  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 
607 aa  663  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 
590 aa  739  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  62.96 
 
 
598 aa  763  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  66.89 
 
 
595 aa  827  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
591 aa  816  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 
596 aa  661  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.0223e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  61.85 
 
 
600 aa  749  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2099  aspartyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 
598 aa  754  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 
586 aa  644  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.70105e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
606 aa  637  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 
596 aa  791  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  7.08268e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 
588 aa  785  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  62.18 
 
 
600 aa  756  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 
597 aa  660  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>