More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2215 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
154 aa  300  7.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.56 
 
 
149 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.09 
 
 
145 aa  161  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  55.88 
 
 
139 aa  157  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.68 
 
 
148 aa  151  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.41 
 
 
140 aa  147  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  49.66 
 
 
146 aa  147  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  50.37 
 
 
142 aa  146  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.86 
 
 
148 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.35 
 
 
144 aa  144  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  50.35 
 
 
145 aa  142  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  50 
 
 
146 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  50 
 
 
146 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  49.24 
 
 
142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.14 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.14 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.1 
 
 
144 aa  135  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  53.73 
 
 
141 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  47.83 
 
 
144 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  48.23 
 
 
145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.94 
 
 
144 aa  134  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.14 
 
 
142 aa  134  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  47.1 
 
 
144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.1 
 
 
144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  47.1 
 
 
144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  48.87 
 
 
140 aa  133  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  51.85 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.04 
 
 
142 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  45.77 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  47.33 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  47.33 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.86 
 
 
144 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  47.86 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  48.92 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  46.79 
 
 
150 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.55 
 
 
147 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  47.01 
 
 
147 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  47.01 
 
 
147 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.23 
 
 
150 aa  120  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  44.93 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  43.59 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  43.54 
 
 
154 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.54 
 
 
154 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  42.95 
 
 
150 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  42.95 
 
 
150 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  42.95 
 
 
150 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.15 
 
 
153 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 
141 aa  114  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 
166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  41.1 
 
 
152 aa  114  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.1 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  41.35 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  40.88 
 
 
147 aa  110  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.06 
 
 
149 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.55 
 
 
149 aa  110  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  44.85 
 
 
134 aa  110  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  39.85 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  47.01 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  42.22 
 
 
144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.76 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  44.2 
 
 
147 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  43.85 
 
 
155 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  39.42 
 
 
150 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.03 
 
 
144 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  41.35 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  41.35 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  36.49 
 
 
152 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  44.03 
 
 
136 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  44.03 
 
 
136 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.19 
 
 
151 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  38.64 
 
 
155 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  41.61 
 
 
167 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.98 
 
 
151 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  39.06 
 
 
140 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  36.99 
 
 
141 aa  104  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.19 
 
 
149 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  36.96 
 
 
139 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.7 
 
 
139 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  41.13 
 
 
147 aa  103  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.88 
 
 
150 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 
139 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  40.43 
 
 
146 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.46 
 
 
138 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.09 
 
 
144 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.17 
 
 
139 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  38.64 
 
 
152 aa  101  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 
151 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  38.64 
 
 
143 aa  100  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  38.76 
 
 
152 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  41.41 
 
 
146 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.37 
 
 
162 aa  99.4  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.51 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.88 
 
 
139 aa  98.6  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.46 
 
 
148 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  41.48 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  38.78 
 
 
148 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  41.48 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>