More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2149 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
680 aa  1376  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
697 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.86 
 
 
871 aa  308  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.13 
 
 
639 aa  304  4e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.13 
 
 
657 aa  286  7e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
882 aa  277  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 
791 aa  263  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
911 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
969 aa  253  9e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
767 aa  251  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
781 aa  249  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
764 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1328  histidine kinase  40.2 
 
 
672 aa  247  5e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  34.87 
 
 
1193 aa  247  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
1313 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 
913 aa  244  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  35.61 
 
 
968 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
995 aa  243  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  36.08 
 
 
661 aa  243  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
947 aa  241  3e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
674 aa  241  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
1118 aa  240  7e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
862 aa  240  8e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1177 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 
1116 aa  238  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
1075 aa  237  5e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
747 aa  237  5e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
801 aa  237  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
968 aa  236  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
1433 aa  236  1e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
785 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  35.43 
 
 
578 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  37.92 
 
 
900 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 
962 aa  234  4e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
785 aa  233  8e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 
780 aa  233  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
918 aa  233  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
827 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 
530 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
817 aa  229  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  35.58 
 
 
588 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.85994e-13 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
604 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
957 aa  229  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
717 aa  228  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
902 aa  228  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
1358 aa  228  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
1027 aa  227  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
1069 aa  227  5e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  34.72 
 
 
882 aa  227  5e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 
952 aa  227  5e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
957 aa  227  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
741 aa  227  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 
1199 aa  226  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
1029 aa  226  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 
1090 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
1226 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
873 aa  225  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1002 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1090 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1002 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
1068 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  30.66 
 
 
794 aa  224  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
874 aa  224  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 
1691 aa  224  5e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  30.74 
 
 
810 aa  224  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 
846 aa  224  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
1001 aa  223  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
1369 aa  223  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  31.5 
 
 
853 aa  223  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
1768 aa  223  1e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  31.23 
 
 
589 aa  223  1e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  32.11 
 
 
606 aa  223  1e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 
863 aa  223  1e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
1078 aa  223  1e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  33.18 
 
 
571 aa  222  1e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 
756 aa  222  2e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
902 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  36.24 
 
 
810 aa  221  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 
1362 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
1091 aa  221  4e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.19 
 
 
763 aa  221  4e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.42 
 
 
778 aa  221  4e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.42 
 
 
778 aa  221  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.42 
 
 
778 aa  221  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  29.42 
 
 
778 aa  221  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.42 
 
 
778 aa  221  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
932 aa  221  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  29.42 
 
 
778 aa  221  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.42 
 
 
778 aa  221  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
895 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.42 
 
 
778 aa  221  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.42 
 
 
778 aa  220  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 
1222 aa  220  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  35.37 
 
 
793 aa  220  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 
1326 aa  220  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
1096 aa  220  8e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
947 aa  219  9e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 
1120 aa  219  9e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
1771 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  33.59 
 
 
544 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>