273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2048 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2048  dihydrofolate reductase  100 
 
 
164 aa  328  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  53.09 
 
 
166 aa  153  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 
179 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  49.4 
 
 
163 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  51.85 
 
 
292 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  53.52 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  49.11 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  50.61 
 
 
163 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  47.3 
 
 
172 aa  134  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  47.83 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  43.64 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  49.08 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  47.65 
 
 
170 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  47.44 
 
 
171 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  46.45 
 
 
172 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  49.66 
 
 
169 aa  130  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  49.31 
 
 
161 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 
163 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 
170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 
175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  47.2 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  47.85 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  48.05 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  42.41 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  52.35 
 
 
160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 
166 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  50.71 
 
 
180 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  45.06 
 
 
173 aa  127  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
162 aa  127  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  47.59 
 
 
178 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  50 
 
 
160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  41.77 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  46.3 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  50.35 
 
 
162 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  43.66 
 
 
163 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  44.05 
 
 
177 aa  124  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  49.32 
 
 
195 aa  123  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  45.12 
 
 
171 aa  123  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  39.18 
 
 
171 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 
160 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 
178 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  43.71 
 
 
178 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  47.65 
 
 
173 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  45.32 
 
 
160 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  38.99 
 
 
160 aa  120  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  45.89 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  40.88 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  42.51 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  38.89 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2167  dihydrofolate reductase region  48.41 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  43.62 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  47.01 
 
 
168 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  38.89 
 
 
160 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  45.21 
 
 
164 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  41.22 
 
 
160 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  44.52 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  46.41 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 
162 aa  117  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 
162 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 
162 aa  117  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 
162 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  43.31 
 
 
172 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 
162 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3263  dihydrofolate reductase  45.58 
 
 
171 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254952  normal  0.239963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 
162 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 
162 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  37.27 
 
 
160 aa  117  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  39.46 
 
 
162 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 
169 aa  117  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  43.31 
 
 
172 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  47.3 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  42.51 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  45.88 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  39.62 
 
 
160 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  41.33 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  44.52 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  38.99 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  38.78 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  44.7 
 
 
170 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  46.21 
 
 
170 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 
167 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 
167 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  43.92 
 
 
183 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  42.48 
 
 
171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  38.78 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  42.48 
 
 
171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  39.02 
 
 
171 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  38.1 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  40.83 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  37.27 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  42.75 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>