More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2019 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  75.78 
 
 		 226 aa  312  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  68.02 
 
 		 228 aa  278  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  58.59 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  50.92 
 
 		 232 aa  201  9e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  48.64 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  47.73 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  54.24 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  45.5 
 
 		 276 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  50 
 
 		 283 aa  169  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  46.15 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  43.52 
 
 		 264 aa  167  9e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  42.6 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  47.29 
 
 		 273 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  43.96 
 
 		 273 aa  161  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  41.86 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  43.81 
 
 		 196 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  37.26 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  39.61 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  41.43 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  37.24 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5568  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  40.8 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  36.45 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  36.45 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  38.19 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  36.45 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  38.19 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  38.19 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  38.19 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  42.79 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  34.6 
 
 		 258 aa  121  8e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  34.82 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  32.85 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  32.06 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  33.65 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  38.65 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  38.65 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3810  Rhomboid family protein  58.23 
 
 		 261 aa  95.5  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.450903  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0633  hypothetical protein  57.32 
 
 		 263 aa  89  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  33.13 
 
 		 291 aa  85.5  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0015  rhomboid family membrane protein  44.57 
 
 		 264 aa  85.1  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  29.96 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  29.61 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  29.33 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  32.18 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  30.3 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  30.95 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  30.7 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  29.17 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  30.81 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  27.35 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  28.96 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  31.03 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  31.52 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  28.18 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  29.81 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0861  Rhomboid family protein  48.31 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  30.22 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.05 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  32.13 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  28.07 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  29.55 
 
 		 240 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  33.09 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  30.73 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  27.85 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  26.98 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  27.93 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  32.77 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  28.98 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  29.47 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  28.51 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  28.08 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  31.92 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  30.74 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  31.47 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  26.43 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  27.69 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  27.97 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  29.82 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  29.3 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  27.83 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  30.18 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  38.06 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  29.05 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  28.15 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  30.13 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  33.73 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  27.68 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  33.73 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  28.4 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  30.91 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  26.94 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  30 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  30.57 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  37.25 
 
 		 554 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  35.21 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  27.75 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>