121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2014 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  100 
 
 
426 aa  824    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  64.07 
 
 
460 aa  532  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  61.54 
 
 
441 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  55.77 
 
 
444 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  35.93 
 
 
447 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
414 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  36.53 
 
 
430 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 
428 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  35.53 
 
 
436 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 
433 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  32.85 
 
 
425 aa  179  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
426 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
451 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
421 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  29.7 
 
 
416 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  27.4 
 
 
435 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  26.9 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  26.64 
 
 
458 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  28 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  29.7 
 
 
453 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  28.6 
 
 
453 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  26.54 
 
 
463 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
465 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  25.18 
 
 
424 aa  124  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
421 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  29.72 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  29.26 
 
 
426 aa  117  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  28.8 
 
 
446 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  26.44 
 
 
462 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  26.12 
 
 
474 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  25.82 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  27.23 
 
 
466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  26.54 
 
 
465 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  25.79 
 
 
429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  24.72 
 
 
454 aa  110  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 
435 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  28.6 
 
 
460 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  25.29 
 
 
469 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  26.81 
 
 
443 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  25.06 
 
 
462 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
430 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  27.83 
 
 
466 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
456 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  26.3 
 
 
465 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 
462 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
469 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  25.6 
 
 
492 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
450 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  26.57 
 
 
460 aa  97.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
442 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
462 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
572 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  24.53 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  26 
 
 
436 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  27.84 
 
 
464 aa  93.2  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  27.23 
 
 
464 aa  93.2  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  26.63 
 
 
448 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  23.6 
 
 
474 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
404 aa  92  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  23.11 
 
 
437 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  22.22 
 
 
440 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 
472 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  26.97 
 
 
462 aa  87.4  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 
454 aa  86.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  26.46 
 
 
467 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
467 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  22.35 
 
 
455 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  27.54 
 
 
456 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  27.3 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  28.31 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  22.52 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  25.65 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  27.71 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  22.25 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  24.03 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  24.89 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  24.19 
 
 
439 aa  77  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  22.99 
 
 
493 aa  77  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  23.79 
 
 
427 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  27.55 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  23.37 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  23.79 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  23.79 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  23.79 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  23.79 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  23.79 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  25.42 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  23.41 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  23.86 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  23.79 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>