25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1997 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  779    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  31.93 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2523  hypothetical protein  24.92 
 
 
317 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  20.96 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1191  hypothetical protein  25.36 
 
 
338 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  25 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  24.47 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3741  plasmid segregation protein ParM  22.76 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3280  hypothetical protein  22.9 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000549349  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4719  hypothetical protein  25.85 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2365  hypothetical protein  25.59 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000580643  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4593  hypothetical protein  26.47 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.992954  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  24.37 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  24.08 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  28.02 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0315  hypothetical protein  23.75 
 
 
509 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0106  plasmid stability protein StbA family protein  20.91 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0675  hypothetical protein  24.46 
 
 
329 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.358837  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  23.3 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  23.08 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5321  hypothetical protein  22.48 
 
 
344 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2673  hypothetical protein  25.79 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0117  hypothetical protein  23.12 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000532023 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  23.42 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3037  plasmid segregation protein ParM  23.32 
 
 
347 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>