More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1989 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.61 
 
 		 1024 aa  671    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1031 aa  2052    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  52.68 
 
 		 1026 aa  1046    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  34.21 
 
 		 1068 aa  617  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  36.88 
 
 		 1029 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  36.89 
 
 		 1055 aa  614  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  35.36 
 
 		 1022 aa  601  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 		 1062 aa  596  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  35.95 
 
 		 1024 aa  585  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  37.68 
 
 		 1038 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 		 1014 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  33.4 
 
 		 1026 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  35.49 
 
 		 1034 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  36.78 
 
 		 1028 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1064 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 		 1048 aa  570  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  36 
 
 		 1036 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1470 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  36.68 
 
 		 1028 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1051 aa  566  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  34.71 
 
 		 1031 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  34.71 
 
 		 1031 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  34.71 
 
 		 1031 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.51 
 
 		 1031 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1035 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  35.21 
 
 		 1023 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  33.71 
 
 		 1069 aa  562  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  32.66 
 
 		 1496 aa  559  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1032 aa  558  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  34.48 
 
 		 1031 aa  559  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1030 aa  559  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1041 aa  557  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  35.74 
 
 		 1047 aa  558  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  32.79 
 
 		 1037 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1037 aa  559  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  35.78 
 
 		 1028 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  36.78 
 
 		 1052 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1032 aa  556  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  34.61 
 
 		 1042 aa  555  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1039 aa  554  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.62 
 
 		 1032 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.79 
 
 		 1034 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1031 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1031 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1036 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1037 aa  549  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1031 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1071 aa  545  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  33.92 
 
 		 1031 aa  546  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1065 aa  545  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  34.02 
 
 		 1028 aa  543  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1031 aa  546  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  33.09 
 
 		 1070 aa  544  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1037 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  34.72 
 
 		 1037 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1050 aa  541  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  34.43 
 
 		 1040 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  35.19 
 
 		 1033 aa  541  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  34.63 
 
 		 1046 aa  538  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1032 aa  539  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  32.02 
 
 		 1095 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1033 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1040 aa  534  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1055 aa  534  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  33.43 
 
 		 1035 aa  531  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1025 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1038 aa  532  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1041 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  35.23 
 
 		 1038 aa  532  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1011 aa  527  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1031 aa  526  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1038 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1009 aa  529  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  31.7 
 
 		 1030 aa  529  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 		 1035 aa  525  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  34.67 
 
 		 1040 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1037 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  32.04 
 
 		 1035 aa  521  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3736  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1036 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  31.8 
 
 		 1013 aa  520  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  35.74 
 
 		 1028 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1036 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 		 1041 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1035 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1034 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  33.15 
 
 		 1075 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.51 
 
 		 1040 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1049 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1044 aa  515  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1051 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  34.57 
 
 		 1048 aa  513  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0899  acriflavin resistance protein  34.57 
 
 		 1048 aa  512  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.91 
 
 		 1029 aa  509  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1022 aa  509  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2374  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1034 aa  505  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1043 aa  505  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  32.3 
 
 		 1037 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1051 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  30.83 
 
 		 1036 aa  499  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 		 1042 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>