24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1943 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  337  5e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  38.15 
 
 		 176 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  33.78 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  37.31 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  34.07 
 
 		 176 aa  90.5  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  26.36 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  27.03 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  29.85 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  24.84 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  24.84 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  23.87 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  28.68 
 
 		 114 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  24.81 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  26.25 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  26.62 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  31.67 
 
 		 115 aa  43.9  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  21.6 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  24.64 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  22.31 
 
 		 111 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  24.65 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  23.61 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  23.84 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  24.81 
 
 		 115 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>