160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1940 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  50.53 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  47.93 
 
 		 312 aa  258  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  41.4 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  39.74 
 
 		 337 aa  192  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  33.23 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 		 438 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  34.82 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  26.96 
 
 		 382 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  31.37 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  28.75 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  27.7 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  30.93 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  26.6 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  23.83 
 
 		 367 aa  95.9  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 364 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  30.96 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.86 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  28.98 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.51 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  27.21 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30.51 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  31.93 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.56 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  25.96 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  24.92 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  26.48 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  25.09 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  25.09 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  28.51 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  24.04 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 		 310 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  28.4 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  26.99 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  25 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.99 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  27.4 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  23.45 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  25.08 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  29.47 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  26.62 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  26.04 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2714  metallo-beta-lactamase family protein  27.91 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  23 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  28.91 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  31.93 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  29.13 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>