38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1832 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1832  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  394  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2264  hypothetical protein  59.04 
 
 
199 aa  235  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680426  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0189  hypothetical protein  52.91 
 
 
196 aa  207  8e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0713  hypothetical protein  47.31 
 
 
208 aa  190  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1310  hypothetical protein  47.37 
 
 
197 aa  180  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2333  hypothetical protein  45.16 
 
 
195 aa  179  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000127187  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0063  hypothetical protein  44.15 
 
 
210 aa  154  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1812  membrane lipoprotein lipid attachment site  33.33 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2065  putative lipoprotein  32.72 
 
 
196 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1891  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.72 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.11 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.11 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.11 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.11 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  28.95 
 
 
201 aa  84.7  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  28.65 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.26 
 
 
201 aa  84.3  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.17 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.95 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  28.26 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138757  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  28.26 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000406943  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.42 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  28.26 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  28.26 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004000  putative lipoprotein  30.81 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  28.42 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000421511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  30.26 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  30.81 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  27.72 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  29.73 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  30.06 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0633  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.57 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0606  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.54 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.74 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191679  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1313  membrane lipoprotein lipid attachment site  31.72 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.565237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  24.24 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  28.19 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4205  hypothetical protein  28.65 
 
 
208 aa  41.2  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>