18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1827 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  229  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  38.98 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  47.37 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  42.59 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000342569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  33.04 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_009439  Pmen_1836  hypothetical protein  32.2 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118115  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  38.64 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  38.36 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  34.88 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  41.43 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  31.58 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  29.57 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  32.04 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  30.67 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  38.2 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0718  hypothetical protein  32.97 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>