More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1819 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1819  4-coumarate--CoA ligase  100 
 
 
394 aa  791  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0064272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2648  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  38.02 
 
 
403 aa  202  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3671  4-coumarate--CoA ligase  33.42 
 
 
411 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.0402717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0103  4-coumarate--CoA ligase  29.71 
 
 
367 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  32.04 
 
 
443 aa  79.7  7e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  30.7 
 
 
453 aa  79  1e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 
557 aa  78.6  2e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 
557 aa  78.6  2e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.28 
 
 
565 aa  76.3  1e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.81 
 
 
565 aa  75.1  2e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.75 
 
 
345 aa  75.5  2e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  31.03 
 
 
590 aa  72.4  1e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 
570 aa  72.4  1e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  31.03 
 
 
590 aa  72.4  1e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  31.37 
 
 
448 aa  72.4  1e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  30.5 
 
 
580 aa  72.8  1e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  28.92 
 
 
459 aa  71.6  2e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  28.53 
 
 
562 aa  71.6  2e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  29.18 
 
 
459 aa  71.2  3e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  27.69 
 
 
454 aa  71.2  3e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26637e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  29.26 
 
 
457 aa  70.1  6e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  31.1 
 
 
584 aa  69.7  7e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 
458 aa  69.7  9e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.02 
 
 
514 aa  68.9  1e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  30.31 
 
 
563 aa  69.3  1e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1846  acyl-CoA synthetase  25.49 
 
 
412 aa  67.8  3e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.259612  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 
446 aa  67.4  4e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2018  acyl-CoA synthetase  25.16 
 
 
412 aa  67  5e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.75082e-44 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 
561 aa  67  6e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  28.43 
 
 
435 aa  66.6  6e-10  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1814  acyl-CoA synthetase  25.16 
 
 
412 aa  67  6e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0396009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  26.09 
 
 
453 aa  67  6e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  28.89 
 
 
450 aa  66.6  8e-10  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.8 
 
 
512 aa  66.6  8e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  25.6 
 
 
454 aa  65.9  1e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1983  acyl-CoA synthetase  24.84 
 
 
412 aa  65.5  1e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 
615 aa  66.2  1e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1840  acyl-CoA synthetase  24.84 
 
 
412 aa  65.5  1e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1985  acyl-CoA synthetase  25.82 
 
 
412 aa  65.9  1e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  25.14 
 
 
533 aa  64.7  2e-09  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  29.17 
 
 
501 aa  65.5  2e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  23.37 
 
 
492 aa  64.7  2e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3344  acyl-CoA synthetase  25.49 
 
 
412 aa  65.5  2e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  hitchhiker  2.07537e-14 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  22.15 
 
 
393 aa  65.5  2e-09  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  22.11 
 
 
448 aa  65.1  2e-09  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1797  acyl-CoA synthetase  25.16 
 
 
412 aa  64.3  3e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  25.64 
 
 
466 aa  63.9  5e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.69 
 
 
354 aa  63.5  6e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  29.14 
 
 
609 aa  63.5  6e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.69 
 
 
354 aa  63.5  6e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 
551 aa  63.5  6e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.69 
 
 
354 aa  63.5  7e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  24.53 
 
 
454 aa  63.2  7e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  24.41 
 
 
455 aa  63.2  8e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  24.27 
 
 
557 aa  62.8  9e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 
568 aa  62.4  1e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  27.22 
 
 
457 aa  62.8  1e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.1 
 
 
569 aa  61.6  2e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  25.66 
 
 
519 aa  61.6  2e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.12 
 
 
510 aa  61.6  2e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.22 
 
 
361 aa  61.6  3e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  24.41 
 
 
427 aa  61.2  3e-08  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  22.97 
 
 
565 aa  61.2  3e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  29.45 
 
 
466 aa  61.2  3e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  24.68 
 
 
454 aa  60.8  4e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  24.68 
 
 
454 aa  60.8  4e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 
560 aa  60.8  4e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  24.68 
 
 
454 aa  60.5  5e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  24.68 
 
 
454 aa  60.1  6e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  24.85 
 
 
490 aa  60.5  6e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  24.35 
 
 
557 aa  60.5  6e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.9 
 
 
510 aa  60.5  6e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  28.83 
 
 
609 aa  60.1  6e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  35.45 
 
 
1035 aa  59.7  8e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.43 
 
 
510 aa  59.7  9e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 
372 aa  59.3  1e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.9 
 
 
510 aa  59.3  1e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.9 
 
 
510 aa  59.3  1e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  25 
 
 
454 aa  59.3  1e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.9 
 
 
510 aa  59.3  1e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.9 
 
 
510 aa  59.3  1e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  25 
 
 
523 aa  59.3  1e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.15 
 
 
510 aa  58.9  2e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 
534 aa  58.2  2e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.27614e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4782  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  23.4 
 
 
348 aa  58.9  2e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  25 
 
 
454 aa  58.5  2e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3695  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 
534 aa  58.9  2e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  25 
 
 
454 aa  58.5  2e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0956  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 
533 aa  58.2  3e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  24.06 
 
 
562 aa  58.2  3e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.15 
 
 
510 aa  57.8  3e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.17 
 
 
510 aa  57.8  3e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  24.61 
 
 
454 aa  57.8  3e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3231  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
534 aa  57.8  4e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  4.48213e-07  normal  0.730696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  25.15 
 
 
503 aa  57.4  4e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 
593 aa  57.4  4e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.63 
 
 
532 aa  57.8  4e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3334  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 
533 aa  57.4  4e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0892803  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 
533 aa  57.4  4e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3139  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
534 aa  57.8  4e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.26557e-05  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>