More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1785 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
250 aa  480  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35.1 
 
 
381 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  38.76 
 
 
521 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.05 
 
 
449 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  46.11 
 
 
1033 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.78 
 
 
213 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  37.89 
 
 
517 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  37.81 
 
 
286 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 
401 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  38.14 
 
 
311 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 
401 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  37.28 
 
 
401 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  40.09 
 
 
216 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  37.31 
 
 
493 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  36.59 
 
 
340 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.59 
 
 
576 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  38.54 
 
 
214 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.01 
 
 
309 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  38.74 
 
 
567 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  39.3 
 
 
278 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  38.5 
 
 
386 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  36.95 
 
 
320 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  34.55 
 
 
448 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  36.69 
 
 
401 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  35.83 
 
 
483 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 
862 aa  99.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  36.8 
 
 
389 aa  99  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  40.31 
 
 
204 aa  98.6  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  39.2 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  41.18 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  35.37 
 
 
333 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  31.47 
 
 
291 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.65 
 
 
336 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  38.12 
 
 
351 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.65 
 
 
336 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  31.33 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  35.96 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  36.02 
 
 
241 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  32.26 
 
 
734 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 
343 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  36.55 
 
 
332 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  36.1 
 
 
745 aa  96.3  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 
343 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  35.14 
 
 
234 aa  95.5  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  36.22 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 
441 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.65 
 
 
319 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  37.57 
 
 
215 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  36.92 
 
 
268 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  35.68 
 
 
213 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  34.85 
 
 
493 aa  92.4  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  33.7 
 
 
600 aa  92.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  41.12 
 
 
277 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  38.99 
 
 
189 aa  92  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
973 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  36.11 
 
 
227 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  40.53 
 
 
203 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  34.55 
 
 
1191 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  35.98 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  34.2 
 
 
489 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  33.96 
 
 
219 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  33 
 
 
262 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  39.61 
 
 
412 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  33 
 
 
262 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  43.68 
 
 
299 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  41.18 
 
 
184 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
727 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  31.92 
 
 
710 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  30.92 
 
 
440 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  36.95 
 
 
263 aa  85.9  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  43.48 
 
 
416 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 
180 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  34.6 
 
 
412 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  37.8 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  36.48 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  39.41 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  32.99 
 
 
880 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  34.7 
 
 
515 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  32.99 
 
 
877 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 
446 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  38.54 
 
 
776 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  33 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  31.49 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  39.78 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  37.37 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  36.7 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  33.49 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  33.97 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  38.51 
 
 
485 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  35.85 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  35.85 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  36.57 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  30.6 
 
 
706 aa  82.4  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  36.81 
 
 
219 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  32.49 
 
 
880 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  39.61 
 
 
903 aa  82  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  32.49 
 
 
880 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  32.49 
 
 
880 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  35.62 
 
 
452 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>