More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1738 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  40.02 
 
 		 1044 aa  716    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  49.81 
 
 		 1031 aa  946    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  41.32 
 
 		 1051 aa  737    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  36.2 
 
 		 1012 aa  649    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  40.53 
 
 		 1014 aa  666    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  50.05 
 
 		 1035 aa  987    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.36 
 
 		 1024 aa  929    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  39.92 
 
 		 1014 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  49.71 
 
 		 1031 aa  950    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.54 
 
 		 1029 aa  883    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  48.84 
 
 		 1031 aa  957    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  41.21 
 
 		 1043 aa  716    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  43.38 
 
 		 1037 aa  796    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  40.24 
 
 		 1029 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.27 
 
 		 1031 aa  954    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.22 
 
 		 1046 aa  760    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  40.06 
 
 		 1018 aa  666    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  50.98 
 
 		 1052 aa  866    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  49.9 
 
 		 1031 aa  945    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  36.77 
 
 		 1015 aa  638    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  39.84 
 
 		 1037 aa  725    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  43.79 
 
 		 1042 aa  771    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  44.96 
 
 		 1048 aa  763    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  49.52 
 
 		 1031 aa  958    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  48.5 
 
 		 1034 aa  947    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  46.26 
 
 		 1045 aa  821    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.45 
 
 		 1057 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0857  acriflavin resistance protein  38.49 
 
 		 1033 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  42.9 
 
 		 1047 aa  771    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3736  acriflavin resistance protein  38.58 
 
 		 1036 aa  687    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  46.34 
 
 		 1024 aa  840    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  37.46 
 
 		 1019 aa  668    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  40.12 
 
 		 1009 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  43.87 
 
 		 1048 aa  728    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  38.83 
 
 		 1037 aa  703    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  42.8 
 
 		 1047 aa  770    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  43.18 
 
 		 1049 aa  750    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  46.61 
 
 		 1023 aa  817    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  42.58 
 
 		 1036 aa  785    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  45.91 
 
 		 1028 aa  854    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.67 
 
 		 1034 aa  914    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  42.51 
 
 		 1046 aa  768    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  49.37 
 
 		 1041 aa  871    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  53.7 
 
 		 1037 aa  1010    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3699  acriflavin resistance protein  38.62 
 
 		 1029 aa  660    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.459748  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  48.55 
 
 		 1041 aa  854    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  46.9 
 
 		 1025 aa  813    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  41.11 
 
 		 1043 aa  713    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  43.96 
 
 		 1035 aa  787    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  38.82 
 
 		 1037 aa  704    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  42.51 
 
 		 1051 aa  758    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  39.33 
 
 		 1017 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  37.36 
 
 		 1019 aa  667    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  41.62 
 
 		 1051 aa  737    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  42.37 
 
 		 1036 aa  781    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  41.29 
 
 		 1050 aa  714    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  45.62 
 
 		 1064 aa  847    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  54.64 
 
 		 1038 aa  988    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0899  acriflavin resistance protein  43.68 
 
 		 1048 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  42.43 
 
 		 1033 aa  758    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  42.8 
 
 		 1047 aa  770    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  45.13 
 
 		 1051 aa  830    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  48.98 
 
 		 1031 aa  911    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  44.47 
 
 		 1029 aa  801    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  45.52 
 
 		 1022 aa  867    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  37.82 
 
 		 1040 aa  656    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  49.9 
 
 		 1031 aa  947    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  50.34 
 
 		 1035 aa  884    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  42.9 
 
 		 1037 aa  799    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  40.42 
 
 		 1014 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  37.4 
 
 		 1032 aa  668    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  50.19 
 
 		 1036 aa  961    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  39.55 
 
 		 1024 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  43.39 
 
 		 1040 aa  769    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  48.46 
 
 		 1042 aa  930    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  37.63 
 
 		 1026 aa  694    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  38.25 
 
 		 1030 aa  693    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  36.3 
 
 		 1012 aa  651    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.84 
 
 		 1068 aa  786    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  42.51 
 
 		 1051 aa  758    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  49.52 
 
 		 1031 aa  958    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  42.41 
 
 		 1051 aa  758    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  49.61 
 
 		 1031 aa  958    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  71.86 
 
 		 1036 aa  1408    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  42.9 
 
 		 1047 aa  770    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  42.41 
 
 		 1034 aa  795    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  49.95 
 
 		 1040 aa  907    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  61.95 
 
 		 1048 aa  1245    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  43.25 
 
 		 1035 aa  793    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1038 aa  2019    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  39.86 
 
 		 1018 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  45.66 
 
 		 1040 aa  762    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  42.24 
 
 		 1044 aa  753    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  49.81 
 
 		 1031 aa  947    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  51.32 
 
 		 1046 aa  958    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  40.72 
 
 		 1014 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  48.21 
 
 		 1030 aa  959    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  37.27 
 
 		 1032 aa  634  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  37.51 
 
 		 1034 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1611  acriflavin resistance protein  37.94 
 
 		 1028 aa  634  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.921522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>