More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1730 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
313 aa  622  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  41.02 
 
 
334 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  41.02 
 
 
334 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  40.46 
 
 
346 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  38.79 
 
 
347 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  48.24 
 
 
329 aa  254  1e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  43.62 
 
 
303 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  40.37 
 
 
344 aa  245  7e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  41.69 
 
 
308 aa  243  2e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  40.39 
 
 
351 aa  241  8e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  44.2 
 
 
332 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.76 
 
 
321 aa  214  2e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  6.94266e-06  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  41.28 
 
 
309 aa  213  3e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  39.06 
 
 
295 aa  213  3e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.91 
 
 
352 aa  212  6e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.57 
 
 
310 aa  212  6e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.93 
 
 
314 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  35.28 
 
 
328 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.93 
 
 
314 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.93 
 
 
314 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.93 
 
 
314 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.93 
 
 
314 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.57 
 
 
310 aa  208  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.65105e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  38.05 
 
 
293 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.57 
 
 
310 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.57 
 
 
310 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  38.57 
 
 
328 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  9.35054e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.01 
 
 
310 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.57 
 
 
310 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.50264e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  38.57 
 
 
310 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.84 
 
 
340 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.26 
 
 
318 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.30529e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  42.23 
 
 
297 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.88 
 
 
339 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.39 
 
 
318 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  2.51275e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.58 
 
 
339 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  39.34 
 
 
307 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.54 
 
 
314 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.05 
 
 
340 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  34.92 
 
 
297 aa  201  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  39.34 
 
 
307 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  38.71 
 
 
302 aa  196  4e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  37.99 
 
 
313 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  34.65 
 
 
362 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  39.51 
 
 
318 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  38.71 
 
 
302 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  38.46 
 
 
311 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  38.39 
 
 
302 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  48.89 
 
 
371 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  35.62 
 
 
297 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  35.43 
 
 
334 aa  173  3e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  38.24 
 
 
345 aa  173  3e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  46.11 
 
 
369 aa  172  7e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  39.94 
 
 
347 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.03 
 
 
282 aa  169  5e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  29.28 
 
 
287 aa  168  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  31.12 
 
 
293 aa  162  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 
326 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 
301 aa  146  4e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  40.22 
 
 
356 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  29.47 
 
 
321 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  37.5 
 
 
378 aa  135  7e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  33.53 
 
 
372 aa  126  6e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4495  periplasmic solute binding protein  43.82 
 
 
350 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  27.84 
 
 
303 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  31.1 
 
 
294 aa  116  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.67 
 
 
320 aa  113  4e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  34.46 
 
 
311 aa  113  4e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  33.09 
 
 
312 aa  113  4e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  28.33 
 
 
306 aa  111  1e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  4.44188e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  26.46 
 
 
317 aa  112  1e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  28.93 
 
 
292 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
295 aa  109  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  28.21 
 
 
368 aa  109  7e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  27.22 
 
 
328 aa  108  9e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.88581e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 
311 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  30.39 
 
 
311 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  25.44 
 
 
339 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  26.46 
 
 
285 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  29 
 
 
309 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  25.74 
 
 
302 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.73282e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  25.45 
 
 
308 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.03257e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  27.4 
 
 
292 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.4 
 
 
365 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 
310 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  25.69 
 
 
314 aa  99  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  25.28 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 
312 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  32.17 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  26.89 
 
 
358 aa  95.9  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 
318 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  25.71 
 
 
322 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  29.79 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  28.35 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.59 
 
 
318 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  27.99 
 
 
331 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  28.76 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  28.3 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2335  periplasmic solute binding protein  31.98 
 
 
309 aa  92.4  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>