More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1679 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1679  DNA polymerase III alpha subunit-like protein  100 
 
 
590 aa  1157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0065962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  28.87 
 
 
1162 aa  119  1e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  28.24 
 
 
1159 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0583  DNA polymerase III, alpha subunit  26.11 
 
 
1168 aa  112  1e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  27.62 
 
 
1122 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  25.12 
 
 
1161 aa  110  6e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  26.33 
 
 
1104 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  26.67 
 
 
1165 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  28.4 
 
 
1182 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1251  DNA polymerase III subunit alpha  26.72 
 
 
1196 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.477204 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  25.5 
 
 
1145 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  27.03 
 
 
1130 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  28.21 
 
 
1170 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  27.63 
 
 
1132 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  30.06 
 
 
1075 aa  105  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  24.87 
 
 
1166 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  24.87 
 
 
1167 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  25.27 
 
 
1163 aa  104  6e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  23.58 
 
 
1165 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  27.71 
 
 
1170 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  25 
 
 
1134 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  27.64 
 
 
1170 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  24.28 
 
 
1149 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  24 
 
 
1165 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  26.22 
 
 
1127 aa  102  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  28 
 
 
1143 aa  101  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  28.64 
 
 
1092 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  26.01 
 
 
1149 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  28 
 
 
1143 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  26.51 
 
 
1139 aa  100  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  26.41 
 
 
1176 aa  100  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  24.74 
 
 
1165 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  24.1 
 
 
1139 aa  100  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  29.97 
 
 
1257 aa  99.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  25.34 
 
 
1159 aa  99.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  27.53 
 
 
1195 aa  99.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  24.03 
 
 
1165 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  25.33 
 
 
1151 aa  99.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0167  DNA polymerase III, alpha subunit  26.59 
 
 
1077 aa  99.4  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  25.72 
 
 
1158 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  26.97 
 
 
1183 aa  98.6  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  26.72 
 
 
1210 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  27.23 
 
 
1217 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  26.07 
 
 
1171 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  25.28 
 
 
1172 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  27.47 
 
 
1262 aa  97.4  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  25.57 
 
 
1172 aa  97.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  22.95 
 
 
1158 aa  97.1  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  26.59 
 
 
1210 aa  97.1  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  25.76 
 
 
1181 aa  97.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  22.95 
 
 
1158 aa  97.1  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  22.95 
 
 
1158 aa  97.1  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  25.15 
 
 
1173 aa  96.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0174  DNA polymerase III subunit alpha  25.35 
 
 
1193 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.224841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  26.49 
 
 
1156 aa  96.3  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0153  DNA polymerase III subunit alpha  25.35 
 
 
1193 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  27.62 
 
 
1174 aa  96.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3501  DNA polymerase III, alpha subunit  25.2 
 
 
1194 aa  96.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173702  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0780  DNA polymerase III, alpha subunit  24.74 
 
 
1109 aa  95.5  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.493984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  28.38 
 
 
1168 aa  96.3  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1232  DNA polymerase III, alpha subunit  25.82 
 
 
1203 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.650603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  28.03 
 
 
1155 aa  95.9  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.31804e-06  hitchhiker  5.68126e-06 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  25.06 
 
 
1185 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002762  DNA polymerase III alpha subunit  23.56 
 
 
1159 aa  95.5  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  25.67 
 
 
1159 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  26.91 
 
 
1162 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  26.44 
 
 
1210 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  27.94 
 
 
1155 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05648  DNA polymerase III subunit alpha  25.45 
 
 
1196 aa  95.1  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  4.34171e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  22.91 
 
 
1065 aa  95.5  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  26.33 
 
 
1247 aa  95.1  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.710188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  27.89 
 
 
1177 aa  95.5  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1214  DNA polymerase III, alpha subunit  26.05 
 
 
1247 aa  94.7  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.69236  normal  0.734793 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  24.02 
 
 
1065 aa  94  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3146  DNA polymerase III subunit alpha  24.73 
 
 
1157 aa  94.4  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0156717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  26.06 
 
 
1157 aa  94.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  24.02 
 
 
1065 aa  94  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  24.17 
 
 
1108 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  23.6 
 
 
1158 aa  94  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  22.91 
 
 
1158 aa  94.4  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  24.17 
 
 
1108 aa  94  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  24.17 
 
 
1108 aa  94  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  24.17 
 
 
1108 aa  94  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  24.17 
 
 
1108 aa  94  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  22.95 
 
 
1157 aa  94  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  24.17 
 
 
1108 aa  94  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  24.17 
 
 
1108 aa  94  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  25.66 
 
 
1160 aa  93.6  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0255  DNA polymerase III, alpha subunit  29.2 
 
 
1322 aa  93.6  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  26.88 
 
 
1141 aa  93.2  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  3.42881e-05  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1898  DNA polymerase III, alpha subunit  24.63 
 
 
1179 aa  92.8  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  24.78 
 
 
1160 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  24.78 
 
 
1160 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10990  DNA polymerase III subunit alpha  27.68 
 
 
1191 aa  93.6  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.997232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03222  DNA polymerase III subunit alpha  25.74 
 
 
1143 aa  93.6  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  24.63 
 
 
1187 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  24.78 
 
 
1160 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  24.78 
 
 
1160 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  24.78 
 
 
1160 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  23.92 
 
 
1108 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>