23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1615 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1615  hydroxyneurosporene synthase  100 
 
 		 275 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6442  hydroxyneurosporene synthase  48.33 
 
 		 404 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2047  hydroxyneurosporene synthase  50.93 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.329916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1288  hydroxyneurosporene synthase  47.78 
 
 		 319 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3761  hydroxyneurosporene synthase  44.65 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1705  hydroxyneurosporene synthase  46.13 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4006  hydroxyneurosporene synthase  45.02 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2985  hydroxyneurosporene synthase  48.8 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.813569  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2823  hydroxyneurosporene synthase  46.3 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.293634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2725  hydroxyneurosporene synthase  46.13 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3692  hydroxyneurosporene synthase  44.98 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2847  hydroxyneurosporene synthase  45.02 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2952  hydroxyneurosporene synthase  45.02 
 
 		 299 aa  221  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1911  hydroxyneurosporene synthase  38.01 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0267  hydroxyneurosporene synthase  38.01 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2041  hydroxyneurosporene synthase  36.9 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.42927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0184  hydroxyneurosporene synthase  37.45 
 
 		 240 aa  168  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3512  hydroxyneurosporene dehydrogenase  36.03 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.411163  normal  0.914235 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0360  hydroxyneurosporene synthase  23.08 
 
 		 376 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0314991  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0393  hydroxyneurosporene synthase CrtC  26.43 
 
 		 373 aa  45.8  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  40.58 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0428  hydroxyneurosporene synthase  22.96 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000692548  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0465  hydroxyneurosporene synthase  27.98 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>