More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1598 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  81.19 
 
 
404 aa  667  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
408 aa  821  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  60 
 
 
429 aa  505  1e-142  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  61.04 
 
 
410 aa  507  1e-142  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  59.65 
 
 
404 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  58.9 
 
 
429 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  58.71 
 
 
410 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  58.75 
 
 
418 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  58.25 
 
 
418 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  60.99 
 
 
404 aa  494  1e-138  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  59.9 
 
 
412 aa  492  1e-138  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  59.7 
 
 
411 aa  493  1e-138  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  58.69 
 
 
410 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  57.39 
 
 
405 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  61.39 
 
 
405 aa  486  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  58.85 
 
 
404 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  57.11 
 
 
404 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  60.85 
 
 
405 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  57.92 
 
 
406 aa  479  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  61.1 
 
 
405 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  55.72 
 
 
404 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  55.47 
 
 
404 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  54.48 
 
 
404 aa  469  1e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  55.5 
 
 
415 aa  470  1e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  55.17 
 
 
438 aa  455  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  55.53 
 
 
413 aa  451  1e-125  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  49.88 
 
 
398 aa  405  1e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  44.89 
 
 
398 aa  340  3e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.52134e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  45.75 
 
 
411 aa  315  1e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  43.6 
 
 
407 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  42.68 
 
 
406 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  41.02 
 
 
432 aa  266  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  42.07 
 
 
420 aa  265  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  40.9 
 
 
419 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  39.16 
 
 
409 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  39.59 
 
 
409 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  39.95 
 
 
421 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  39.9 
 
 
406 aa  254  2e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  39.24 
 
 
414 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  41.6 
 
 
417 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  41.6 
 
 
417 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  41.6 
 
 
417 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  39.4 
 
 
403 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  36.6 
 
 
400 aa  249  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  40.7 
 
 
429 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  40.05 
 
 
410 aa  242  8e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  40.1 
 
 
410 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  53.74 
 
 
435 aa  234  2e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  40.36 
 
 
419 aa  234  2e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  39.51 
 
 
419 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  51.67 
 
 
400 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  51.2 
 
 
400 aa  229  5e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  39.68 
 
 
380 aa  229  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  42.19 
 
 
306 aa  220  4e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  42.19 
 
 
306 aa  220  4e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  40.67 
 
 
303 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  52.02 
 
 
281 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  50.98 
 
 
326 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  47.81 
 
 
285 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  46.9 
 
 
326 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  47.98 
 
 
297 aa  202  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  47.81 
 
 
310 aa  202  1e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  46.38 
 
 
317 aa  201  2e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  47.81 
 
 
285 aa  201  2e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  49.78 
 
 
281 aa  201  2e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  48.78 
 
 
328 aa  199  8e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  47.51 
 
 
276 aa  199  8e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  48.07 
 
 
281 aa  199  1e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  40.34 
 
 
322 aa  198  1e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  47.52 
 
 
279 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  48.07 
 
 
281 aa  197  4e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  47.72 
 
 
279 aa  197  4e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  49.33 
 
 
316 aa  196  5e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  49.33 
 
 
316 aa  196  5e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  48.29 
 
 
306 aa  196  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 
325 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  49.77 
 
 
279 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  50.72 
 
 
326 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  50.72 
 
 
326 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  50.72 
 
 
326 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  44.68 
 
 
302 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
235 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 
325 aa  193  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  48.08 
 
 
322 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  193  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  48.08 
 
 
322 aa  193  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  193  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  193  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  193  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 
322 aa  193  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 
357 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 
325 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 
322 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  46.78 
 
 
281 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 
322 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 
322 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 
322 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  47.6 
 
 
322 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  47.96 
 
 
325 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>