More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1550 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  52.87 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  53.69 
 
 		 246 aa  252  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  52.05 
 
 		 246 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  55.1 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  51.64 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  53.69 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  47.76 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 250 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 		 243 aa  184  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 243 aa  171  9e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 		 245 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.54 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  38.59 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  30.12 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  32.38 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  30.8 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  30.8 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  28.81 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  29.2 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  30.04 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 		 267 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2785  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.86 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0427  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.28 
 
 		 244 aa  95.5  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.46714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  29.22 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0185  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.63 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 		 277 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 264 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  36.46 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.16 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  28.98 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4782  short chain dehydrogenase  30.16 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2291  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.53 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3288  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.53 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2168  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.53 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408948  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0537  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.53 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.53 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3273  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.53 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  30.28 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>