More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1402 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1361  isocitrate lyase  73.32 
 
 		 435 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1358  isocitrate lyase  73.08 
 
 		 443 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.355427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2470  isocitrate lyase  73.32 
 
 		 435 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1229  isocitrate lyase  73.49 
 
 		 425 aa  651    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2088  isocitrate lyase  73.32 
 
 		 475 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00747543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1287  isocitrate lyase  73.25 
 
 		 425 aa  647    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000193732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1295  isocitrate lyase  71.57 
 
 		 434 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0485225  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1052  isocitrate lyase  73.49 
 
 		 425 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1027  isocitrate lyase  73.01 
 
 		 425 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  73.49 
 
 		 425 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2860  isocitrate lyase  72.58 
 
 		 439 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1586  isocitrate lyase  73.32 
 
 		 435 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0742206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1033  isocitrate lyase  73.49 
 
 		 425 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00237406  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1402  isocitrate lyase  100 
 
 		 422 aa  877    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  73.73 
 
 		 428 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  73.25 
 
 		 428 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  72.53 
 
 		 425 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1961  isocitrate lyase  73.8 
 
 		 431 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2613  isocitrate lyase  73.32 
 
 		 435 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3224  isocitrate lyase  73.32 
 
 		 475 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5357  isocitrate lyase  73.32 
 
 		 435 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1229  isocitrate lyase  73.8 
 
 		 435 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  73.49 
 
 		 425 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  73.49 
 
 		 425 aa  649    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1232  isocitrate lyase  71.57 
 
 		 434 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635123  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1998  isocitrate lyase  73.56 
 
 		 435 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2067  isocitrate lyase  73.8 
 
 		 435 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1651  isocitrate lyase  72.6 
 
 		 434 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232298  normal  0.0282677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1385  isocitrate lyase  74.28 
 
 		 431 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2524  isocitrate lyase  73.32 
 
 		 435 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6029  isocitrate lyase  73.8 
 
 		 435 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  73.1 
 
 		 434 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4157  isocitrate lyase  73.25 
 
 		 425 aa  648    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0289432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1950  isocitrate lyase  74.04 
 
 		 435 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8838  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1182  isocitrate lyase  73.25 
 
 		 425 aa  648    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00317473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2486  isocitrate lyase  72.6 
 
 		 434 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  hitchhiker  0.000410073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2080  isocitrate lyase  74.04 
 
 		 435 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0189  isocitrate lyase  77.35 
 
 		 433 aa  684    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0259015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2048  isocitrate lyase  73.8 
 
 		 435 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  72.05 
 
 		 443 aa  630  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1869  isocitrate lyase  69.98 
 
 		 439 aa  627  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.612764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3098  isocitrate lyase  70.45 
 
 		 432 aa  624  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1335  isocitrate lyase  69.98 
 
 		 439 aa  625  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2063  isocitrate lyase  71.02 
 
 		 426 aa  627  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0040  isocitrate lyase  69.95 
 
 		 426 aa  619  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2101  isocitrate lyase  68.14 
 
 		 439 aa  617  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0829587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2855  isocitrate lyase  69.98 
 
 		 439 aa  618  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1506  isocitrate lyase  69.03 
 
 		 432 aa  615  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  69.06 
 
 		 428 aa  615  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0028  isocitrate lyase  69.36 
 
 		 427 aa  617  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  71.91 
 
 		 430 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1377  isocitrate lyase  69.45 
 
 		 429 aa  609  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1017  isocitrate lyase  69.4 
 
 		 430 aa  605  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28360  isocitrate lyase  68.57 
 
 		 432 aa  604  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.721222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1429  isocitrate lyase  67.94 
 
 		 432 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1276  isocitrate lyase  69.95 
 
 		 450 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4375  isocitrate lyase  67.86 
 
 		 428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2490  isocitrate lyase  68.92 
 
 		 429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000238202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03887  isocitrate lyase  68.71 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3982  isocitrate lyase  68.71 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4520  isocitrate lyase  68.71 
 
 		 434 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2552  isocitrate lyase  69.48 
 
 		 438 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3449  putative isocitrate lyase  69.78 
 
 		 430 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0890897  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  70.27 
 
 		 1111 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4015  isocitrate lyase  68.71 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.857815  normal  0.048313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4430  isocitrate lyase  68.71 
 
 		 434 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4395  isocitrate lyase  68.94 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4249  isocitrate lyase  68.71 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4593  isocitrate lyase  68.71 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4557  isocitrate lyase  68.71 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2766  isocitrate lyase  69.72 
 
 		 440 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0008216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2844  isocitrate lyase  69.48 
 
 		 440 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4469  isocitrate lyase  68.71 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0668028  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4164  isocitrate lyase  67.3 
 
 		 428 aa  600  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.652432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03847  hypothetical protein  68.71 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2942  isocitrate lyase  69.72 
 
 		 440 aa  601  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.337122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4517  isocitrate lyase  68.71 
 
 		 434 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3687  isocitrate lyase  67.52 
 
 		 441 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.978448  normal  0.141916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1239  isocitrate lyase  69.18 
 
 		 440 aa  596  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.18616  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3778  isocitrate lyase  68.47 
 
 		 435 aa  596  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5485  isocitrate lyase  68.47 
 
 		 434 aa  596  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2401  isocitrate lyase  68.38 
 
 		 443 aa  597  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.782792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3957  isocitrate lyase  68.71 
 
 		 435 aa  594  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  70.02 
 
 		 1111 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1447  isocitrate lyase  68.15 
 
 		 443 aa  594  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3042  isocitrate lyase  69.48 
 
 		 441 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1308  isocitrate lyase  69.48 
 
 		 441 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0590884  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1317  isocitrate lyase  69.48 
 
 		 441 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1344  isocitrate lyase  69.48 
 
 		 441 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1009  isocitrate lyase  67.47 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4509  isocitrate lyase  68.47 
 
 		 434 aa  597  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4116  isocitrate lyase  67.05 
 
 		 441 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1484  isocitrate lyase  69.01 
 
 		 440 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0219  isocitrate lyase  66.82 
 
 		 434 aa  592  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0768  isocitrate lyase  68.03 
 
 		 431 aa  592  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  70.22 
 
 		 1111 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0366  isocitrate lyase  68.47 
 
 		 435 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1247  isocitrate lyase  67.45 
 
 		 437 aa  592  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.725065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1748  isocitrate lyase  67.05 
 
 		 441 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.191807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1246  isocitrate lyase  68.78 
 
 		 441 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0481368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>