More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1384 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 524 aa  1035    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  60.31 
 
 		 530 aa  614  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  54.76 
 
 		 526 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  51.02 
 
 		 538 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  52.22 
 
 		 659 aa  497  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  52.02 
 
 		 659 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1851  choline/carnitine/betaine transporter  48.85 
 
 		 543 aa  484  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.993809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  50.89 
 
 		 552 aa  480  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5374  choline/carnitine/betaine transporter family protein  46.85 
 
 		 567 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985383  normal  0.22306 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001291  choline/carnitine/betaine transporter family protein  46.5 
 
 		 578 aa  478  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.335478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  47.14 
 
 		 657 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  52.27 
 
 		 541 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  46.35 
 
 		 551 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  48.05 
 
 		 573 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  51.61 
 
 		 668 aa  455  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  46.65 
 
 		 558 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  47.47 
 
 		 661 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  48.2 
 
 		 542 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  48.28 
 
 		 545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  50.5 
 
 		 660 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  47.91 
 
 		 667 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3436  choline/carnitine/betaine transporter  49.02 
 
 		 526 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.97143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  47.67 
 
 		 661 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  45.97 
 
 		 606 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  46.67 
 
 		 550 aa  443  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2119  betaine/carnitine/choline transporter family protein  45.91 
 
 		 524 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  50.8 
 
 		 673 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  51.02 
 
 		 661 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  48.32 
 
 		 661 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  51.96 
 
 		 658 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  51.65 
 
 		 658 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  46.24 
 
 		 682 aa  437  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  51.96 
 
 		 658 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  51.96 
 
 		 658 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  44.98 
 
 		 637 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  46.98 
 
 		 660 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  47.4 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1546  choline/carnitine/betaine transporter  51.75 
 
 		 658 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  47.15 
 
 		 667 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  44.77 
 
 		 656 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  47.15 
 
 		 667 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  47.01 
 
 		 664 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  46.37 
 
 		 538 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1175  choline/carnitine/betaine transport  49.4 
 
 		 658 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0833615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  47.77 
 
 		 498 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  46.81 
 
 		 685 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  46.95 
 
 		 667 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  47.15 
 
 		 667 aa  425  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  46.48 
 
 		 523 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  50.31 
 
 		 658 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  46.6 
 
 		 497 aa  419  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  45.76 
 
 		 567 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  44.87 
 
 		 506 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  45.27 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  44.55 
 
 		 529 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2719  choline/carnitine/betaine transporter  50.1 
 
 		 658 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  49.16 
 
 		 546 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  43.47 
 
 		 508 aa  415  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  46.84 
 
 		 580 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1077  choline/carnitine/betaine transport  46.15 
 
 		 682 aa  415  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.892042  normal  0.109945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2619  choline/carnitine/betaine transporter  50.1 
 
 		 658 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000908403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  46.53 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  46.44 
 
 		 682 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  46.61 
 
 		 606 aa  415  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  43.88 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  43.97 
 
 		 549 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  45.05 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  45.69 
 
 		 505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  47.33 
 
 		 637 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  44.33 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  45.69 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  45.91 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  45.47 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  45.91 
 
 		 505 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  45.91 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  43.4 
 
 		 584 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  45.91 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  44.08 
 
 		 646 aa  404  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0240  choline/carnitine/betaine transporter  47.66 
 
 		 662 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  45.91 
 
 		 505 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  44.12 
 
 		 698 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  45.91 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1055  choline/carnitine/betaine transporter  47.15 
 
 		 520 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.144567  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  45.69 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  44.42 
 
 		 539 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  44.42 
 
 		 603 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  43.14 
 
 		 550 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  44.58 
 
 		 535 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  44.36 
 
 		 687 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01511  putative high-affinity choline transport protein  45.56 
 
 		 676 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3129  choline/carnitine/betaine transporter  43.43 
 
 		 554 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.32452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  41.77 
 
 		 516 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  44.47 
 
 		 673 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  43.85 
 
 		 676 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  44.33 
 
 		 676 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  43.49 
 
 		 523 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  43.53 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  43.76 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  42.22 
 
 		 526 aa  392  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2045  choline/carnitine/betaine transporter  43.72 
 
 		 554 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0189191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>