More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1247 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
140 aa  274  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.36 
 
 
137 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.32 
 
 
141 aa  140  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.48 
 
 
140 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.37 
 
 
141 aa  116  1e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  43.94 
 
 
142 aa  110  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.41 
 
 
140 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.91 
 
 
140 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.69 
 
 
143 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  3.95657e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 
137 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.37129e-08  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 
142 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  43.85 
 
 
143 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.96 
 
 
142 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 
138 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.74903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.29 
 
 
141 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.06 
 
 
141 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.03 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.96939e-07  hitchhiker  9.05807e-07 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.69 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.96 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.86 
 
 
142 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.69 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.69 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.23 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 
142 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2642  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  39.13 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  34.33 
 
 
154 aa  94  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.03 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  36.03 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  33.58 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  39.34 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  39.34 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
142 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  37.23 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
134 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.88 
 
 
134 aa  86.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  32.84 
 
 
133 aa  87  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1509  biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  35.07 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171101  normal  0.278773 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.8 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.8 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.8 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.38 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  1.53595e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.8 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  36 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.8 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  6.99577e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 
134 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  2.46582e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 
134 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  4.63213e-07 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 
134 aa  84  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  1.06541e-06 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
132 aa  83.2  1e-15  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
134 aa  82.8  1e-15  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  4.57301e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
134 aa  82.4  2e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
149 aa  81.6  3e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  36.57 
 
 
136 aa  81.6  3e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.78844e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.2 
 
 
134 aa  81.3  4e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
136 aa  81.3  4e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 
142 aa  80.9  5e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 
134 aa  79.3  2e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  36.57 
 
 
134 aa  79.3  2e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  38.81 
 
 
136 aa  77.4  7e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.86 
 
 
158 aa  76.3  1e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  34.29 
 
 
135 aa  76.6  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.81 
 
 
136 aa  76.6  1e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
135 aa  74.7  3e-13  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 
136 aa  75.1  3e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.81 
 
 
133 aa  74.3  5e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  34.88 
 
 
136 aa  73.6  8e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  30.6 
 
 
134 aa  73.6  1e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  34.4 
 
 
135 aa  72.4  2e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  31.11 
 
 
132 aa  72  2e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.4 
 
 
135 aa  72.8  2e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.58 
 
 
133 aa  72  3e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  34.09 
 
 
135 aa  71.2  4e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  1.82227e-06 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  29.85 
 
 
134 aa  70.9  5e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  27.82 
 
 
134 aa  70.9  6e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  29.1 
 
 
134 aa  70.1  9e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  28.47 
 
 
134 aa  70.1  9e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.84 
 
 
136 aa  69.3  2e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  32.37 
 
 
148 aa  69.3  2e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.07 
 
 
134 aa  68.9  2e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.54 
 
 
135 aa  68.9  2e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 
144 aa  68.2  3e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0605408  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
158 aa  68.2  3e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1899  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.91 
 
 
144 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  5.11207e-05 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1317  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.83 
 
 
143 aa  68.2  4e-11  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.893415  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.78 
 
 
135 aa  67.4  6e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.11 
 
 
139 aa  66.2  1e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 
154 aa  66.6  1e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  29.66 
 
 
154 aa  66.6  1e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 
142 aa  65.9  2e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.55119e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  32.28 
 
 
143 aa  65.9  2e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0546  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.86 
 
 
152 aa  65.5  2e-10  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00922706  normal  0.113975 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1698  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.12 
 
 
250 aa  65.5  3e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 
131 aa  65.1  3e-10  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>