272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1221 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1221  glycine--tRNA ligase  100 
 
 
696 aa  1377    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.97 
 
 
690 aa  649    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  55.65 
 
 
693 aa  701    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  49.71 
 
 
691 aa  630  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  50.07 
 
 
696 aa  614  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.64 
 
 
692 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.49 
 
 
688 aa  595  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  49.93 
 
 
688 aa  595  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  47.98 
 
 
693 aa  594  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.22 
 
 
689 aa  589  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.22 
 
 
689 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.22 
 
 
689 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2051  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.78 
 
 
692 aa  586  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  45.22 
 
 
689 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.22 
 
 
689 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.22 
 
 
689 aa  587  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.22 
 
 
689 aa  587  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.22 
 
 
689 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.07 
 
 
689 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.93 
 
 
689 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.78 
 
 
689 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  45.35 
 
 
690 aa  581  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.3 
 
 
689 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.09 
 
 
689 aa  579  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.02 
 
 
689 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.78 
 
 
689 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.75 
 
 
694 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.02 
 
 
689 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.02 
 
 
689 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.78 
 
 
689 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.78 
 
 
689 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.19 
 
 
689 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.2 
 
 
689 aa  574  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.2 
 
 
688 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.8 
 
 
689 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.94 
 
 
689 aa  572  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.48 
 
 
688 aa  571  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.14 
 
 
688 aa  567  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2574  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.29 
 
 
693 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568144 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.72 
 
 
689 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.91 
 
 
689 aa  559  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.22 
 
 
684 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.65 
 
 
684 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.37 
 
 
694 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.93 
 
 
684 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.66 
 
 
693 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.14 
 
 
688 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.04 
 
 
689 aa  554  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.75 
 
 
692 aa  554  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0185  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.78 
 
 
684 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.78 
 
 
684 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.6 
 
 
689 aa  551  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00090  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.97 
 
 
684 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.56 
 
 
685 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.49 
 
 
683 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.92 
 
 
697 aa  547  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.78 
 
 
683 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.62 
 
 
684 aa  544  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.6 
 
 
694 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.829353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.19 
 
 
689 aa  544  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002000  glycyl-tRNA synthetase beta chain  44.09 
 
 
688 aa  542  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.49 
 
 
688 aa  538  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2055  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.23 
 
 
697 aa  537  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.35855  normal  0.503298 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.33 
 
 
689 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.19 
 
 
689 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000499537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.63 
 
 
693 aa  534  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.33 
 
 
689 aa  535  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.19 
 
 
689 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.48 
 
 
689 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  45.07 
 
 
685 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1773  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.52 
 
 
697 aa  525  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0663369  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.06 
 
 
688 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.06 
 
 
688 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0016  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  44.19 
 
 
688 aa  525  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  43.17 
 
 
692 aa  522  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1803  glycyl-tRNA synthetase beta chain  42.88 
 
 
688 aa  512  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1804  glycyl-tRNA synthetase beta chain  42.73 
 
 
688 aa  510  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0889  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.75 
 
 
722 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.75 
 
 
722 aa  487  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.40504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03829  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.04 
 
 
745 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  41.54 
 
 
700 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3982  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.63 
 
 
691 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.295232 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0160  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.99 
 
 
699 aa  464  1e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.51 
 
 
694 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2581  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.27 
 
 
694 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2210  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.27 
 
 
694 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.237877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0686  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  42.4 
 
 
699 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509477  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.19 
 
 
705 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0524  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.49 
 
 
697 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0189981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3535  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.4 
 
 
712 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.028288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  39.37 
 
 
688 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0400  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.69 
 
 
697 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.543468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0405  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.26 
 
 
699 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.721596  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0446  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.08 
 
 
707 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0544  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.36 
 
 
720 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0415  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  40.69 
 
 
697 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474954  normal  0.979484 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.17 
 
 
694 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0528  glycine--tRNA ligase  40.78 
 
 
720 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0942391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  41.82 
 
 
699 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454838  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.54 
 
 
687 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>