217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1162 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  100 
 
 		 107 aa  223  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  60.87 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  51.89 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  43.62 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  45.83 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  43.24 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  42.67 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  44.59 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  42.67 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  42.03 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  40.19 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  41.38 
 
 		 124 aa  66.6  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  36.14 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  34.88 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  30 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 273 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  41.79 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  40 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  31.13 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  30.19 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  30.19 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  37.21 
 
 		 218 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 287 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  28.44 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  40.3 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  33.77 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  30 
 
 		 217 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  30 
 
 		 216 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  27.88 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3048  cytochrome c553  44.78 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.58659  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 216 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  35.21 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  26.89 
 
 		 219 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  36.36 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  36.59 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  33.78 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  32.61 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  32.94 
 
 		 240 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  31.37 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  28.75 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5446  putative cytochrome c4 precursor  26.67 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  29.06 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  32.61 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  31.43 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  33.78 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  30 
 
 		 262 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  36.11 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  32.65 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  34.94 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  28.75 
 
 		 262 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  28.75 
 
 		 262 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  28.75 
 
 		 262 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  27.27 
 
 		 257 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 284 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1799  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000599943  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 292 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 224 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  27.94 
 
 		 219 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  33.8 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  33.75 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2894  cytochrome c, class I  32.84 
 
 		 226 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  34.85 
 
 		 253 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  34.85 
 
 		 253 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  34.85 
 
 		 253 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  34.85 
 
 		 249 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  34.85 
 
 		 249 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  29.73 
 
 		 218 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  34.85 
 
 		 249 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  30.49 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  29.91 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 209 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  33.75 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  29.07 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  32.1 
 
 		 257 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  31.94 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  26.04 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  25.81 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  34.78 
 
 		 261 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  34.85 
 
 		 234 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  28.89 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  32.81 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  32.1 
 
 		 217 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  36.92 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  36.92 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  36.92 
 
 		 236 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>