More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1118 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 437 aa  870    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  36.61 
 
 		 542 aa  276  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 878 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  50 
 
 		 685 aa  243  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 662 aa  236  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48 
 
 		 1007 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.82 
 
 		 697 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.69 
 
 		 530 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 653 aa  229  9e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.1 
 
 		 657 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.15 
 
 		 1041 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.59 
 
 		 602 aa  223  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  50 
 
 		 404 aa  223  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1951  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 		 603 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 		 856 aa  219  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 901 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 		 1167 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.81 
 
 		 869 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  44.96 
 
 		 935 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1189  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.51 
 
 		 971 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.03 
 
 		 1118 aa  212  9e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 570 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.27 
 
 		 618 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 679 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  47.95 
 
 		 1077 aa  206  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 		 948 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 		 1145 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.66 
 
 		 783 aa  204  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43120  periplasmic sensory histidine protein kinase  44.16 
 
 		 830 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.22 
 
 		 833 aa  199  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 399 aa  199  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  44.53 
 
 		 957 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 1163 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 		 1141 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 1155 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  44.9 
 
 		 781 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 579 aa  193  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 1155 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  45.97 
 
 		 779 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 937 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  45.56 
 
 		 746 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 1316 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 		 811 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.73 
 
 		 989 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  37.76 
 
 		 1172 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3731  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 411 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  44.65 
 
 		 1257 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 1410 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  37.41 
 
 		 1170 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 		 1203 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 1158 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 		 939 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 		 1149 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  38.97 
 
 		 2051 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 1303 aa  186  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.97 
 
 		 846 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 922 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 947 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2863  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 784 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  45.04 
 
 		 835 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 		 841 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 1274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 1155 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 1214 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  45.55 
 
 		 629 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.57 
 
 		 720 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 		 989 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 		 1069 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 1119 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 		 1075 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1959 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 		 1266 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  38.71 
 
 		 508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 1400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 		 1162 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 784 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1434  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1186 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2100  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.61 
 
 		 637 aa  180  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.269626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.98 
 
 		 827 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 		 1588 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3120  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 752 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  38.89 
 
 		 925 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 882 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 		 633 aa  179  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 573 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 767 aa  179  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 1165 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  38.54 
 
 		 925 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 1130 aa  179  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 844 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  43.62 
 
 		 882 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 		 866 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 		 1369 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.67 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 		 1142 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 844 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 		 770 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>