87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1082 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  100 
 
 
215 aa  435  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  51.83 
 
 
230 aa  214  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  52.17 
 
 
217 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  50.72 
 
 
215 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  47.14 
 
 
215 aa  210  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  51.21 
 
 
223 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  47.14 
 
 
222 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  47.39 
 
 
212 aa  204  8e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  46.19 
 
 
212 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  46.45 
 
 
223 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  53.14 
 
 
257 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  46.45 
 
 
216 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  47.34 
 
 
225 aa  201  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  45.71 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  45.97 
 
 
212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  44.55 
 
 
212 aa  197  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  46.19 
 
 
211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  44.55 
 
 
217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  45.02 
 
 
214 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  46.67 
 
 
212 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  44.39 
 
 
214 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  47.14 
 
 
212 aa  185  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  46.19 
 
 
212 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  45.28 
 
 
212 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  43.13 
 
 
211 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  42.65 
 
 
211 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  43.81 
 
 
211 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  50 
 
 
213 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  45.24 
 
 
222 aa  174  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  47.69 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  43.13 
 
 
233 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  33.68 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  34.2 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  32.56 
 
 
222 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  31.13 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  30.66 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  31.78 
 
 
220 aa  115  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  31.78 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  29.95 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  29.72 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  28 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  31.34 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  30.19 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  29.67 
 
 
212 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  29.19 
 
 
212 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  29.19 
 
 
212 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  29.19 
 
 
212 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  28.04 
 
 
226 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  28.71 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  27.98 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  31.12 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  24.4 
 
 
2490 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.04 
 
 
273 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 
323 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  29.07 
 
 
323 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2872  hypothetical protein  23.64 
 
 
297 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0235  hypothetical protein  23.64 
 
 
273 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0296  hypothetical protein  20.38 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  20.69 
 
 
291 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  21.96 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  29 
 
 
333 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1957  methyltransferase type 11  24.3 
 
 
263 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  19.75 
 
 
332 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  35.42 
 
 
323 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  25 
 
 
304 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  20.18 
 
 
286 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  24.73 
 
 
258 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  25.33 
 
 
305 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
317 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25 
 
 
672 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  27.16 
 
 
401 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  26.05 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1007  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  45.1 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  30.65 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.21 
 
 
345 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  24.65 
 
 
401 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  27.16 
 
 
401 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  26.43 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  28.85 
 
 
1124 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  24.37 
 
 
334 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  27.84 
 
 
336 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  21.08 
 
 
242 aa  42.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
1177 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  26.37 
 
 
1046 aa  42  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.71 
 
 
403 aa  42  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2382  hypothetical protein  36.26 
 
 
179 aa  41.6  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.489391  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.73 
 
 
247 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>