More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1065 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 215 aa  421  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.13 
 
 		 212 aa  244  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.12 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.97 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  41.63 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  40.72 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  37.26 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.86 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  40.18 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.53 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.12 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.6 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.6 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  39.34 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.89 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.86 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.01 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  33.49 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  33.49 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  46.41 
 
 		 374 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.21 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.72 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  39.53 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  38.81 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.12 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  33.48 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.13 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.13 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.13 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.05 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.5 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  37.5 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  37.5 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  36.73 
 
 		 227 aa  114  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  41.74 
 
 		 229 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  36.92 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  36.62 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  37.22 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  36.57 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.8 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.55 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.55 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.55 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  37.56 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.24 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  32.57 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  37.5 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  32.37 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.54 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.21 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  31.89 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.03 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.48 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  32.41 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.82 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  33.11 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  32.37 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.5 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.9 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  34.3 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.67 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  33.65 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  27.06 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  40.47 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  29.69 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  31.88 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  30.23 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  26.92 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  29.76 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  26.82 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  31.19 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  27.35 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>