59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1052 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  61.61 
 
 
224 aa  282  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  48.18 
 
 
225 aa  214  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  47.47 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  49.09 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  48.64 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  47 
 
 
226 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  48.43 
 
 
226 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  47.93 
 
 
226 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  47.22 
 
 
238 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  47.47 
 
 
226 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  47.22 
 
 
226 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  46.08 
 
 
226 aa  206  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  47.47 
 
 
228 aa  205  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  47.47 
 
 
226 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  46.54 
 
 
226 aa  201  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  46.54 
 
 
226 aa  201  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  46.54 
 
 
226 aa  201  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  46.08 
 
 
226 aa  201  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  46.54 
 
 
226 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  46.54 
 
 
226 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  46.54 
 
 
226 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  46.54 
 
 
226 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  46.08 
 
 
228 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  46.54 
 
 
226 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  44.2 
 
 
223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  45.16 
 
 
226 aa  198  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  44.2 
 
 
223 aa  198  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  45.74 
 
 
226 aa  194  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  47.09 
 
 
226 aa  194  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  45.16 
 
 
226 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  41.89 
 
 
225 aa  188  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  42.4 
 
 
226 aa  187  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  48.44 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  43.18 
 
 
226 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  39.73 
 
 
226 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  41.18 
 
 
227 aa  171  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  29.95 
 
 
224 aa  112  6e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  27.7 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  25.66 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  24.55 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  24.11 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  22.32 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  23.47 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  23.47 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  22.75 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  21.97 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  21.39 
 
 
222 aa  52  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  21.15 
 
 
212 aa  51.6  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  24.12 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  22.16 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  24.02 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  19.63 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  23.95 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  23.95 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  24 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  24 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  22.96 
 
 
215 aa  42  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  22.5 
 
 
215 aa  41.6  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>