More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0977 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 147 aa  296  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  68.8 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  57.94 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  56.59 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  56.59 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  57.14 
 
 		 162 aa  137  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  53.49 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  53.49 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  54.03 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  56.8 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  55.65 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  52.67 
 
 		 171 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  53.49 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  53.12 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  53.12 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  53.17 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  52.34 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  54.4 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  50.4 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  49.62 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  49.62 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  49.62 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  51.15 
 
 		 138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  51.59 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  51.2 
 
 		 163 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  51.59 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  51.59 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  50.79 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  50.38 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  50.39 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  48.44 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  44.16 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  52.34 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  52.34 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  45.6 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  43.28 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  59.57 
 
 		 208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  48.8 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  39.16 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  35.66 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  39.16 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  53.19 
 
 		 161 aa  96.7  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  33.83 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  43.62 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  43.62 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  38.38 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  37.4 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  37.4 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  38.14 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  41.05 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  34.91 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  38.89 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  38.46 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  36.84 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  36.84 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  36.84 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  37.78 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  33.83 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  40.22 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  37.63 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0847  ferric uptake regulator, Fur family  39.58 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  37.96 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  37.63 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  32.8 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  36.07 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  36.63 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  35.4 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  34.4 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  35.14 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  36.84 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  36.63 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  36.84 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  35.83 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  36.63 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  37.23 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  36.84 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  40.22 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  36.84 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  36.63 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  36.84 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  36.63 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  34.4 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  34.4 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>