More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0941 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
328 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0346  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80.25 
 
 
321 aa  519  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.32 
 
 
328 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2913  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.65 
 
 
336 aa  448  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.45 
 
 
324 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2409  aspartate carbamoyltransferase  70.29 
 
 
340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.891458  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  69.11 
 
 
333 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.47 
 
 
317 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.86 
 
 
334 aa  435  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  66.77 
 
 
334 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.3 
 
 
334 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0397  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.03 
 
 
335 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.52 
 
 
317 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.3 
 
 
334 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0466  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.09 
 
 
334 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4998  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.09 
 
 
334 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.77 
 
 
336 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.45 
 
 
334 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4872  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.09 
 
 
334 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216485  normal  0.0344479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5048  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.09 
 
 
334 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173326  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.88 
 
 
323 aa  421  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.45 
 
 
334 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.67 
 
 
341 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.42 
 
 
361 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.42 
 
 
343 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.35 
 
 
341 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.41 
 
 
336 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.42 
 
 
343 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.56 
 
 
323 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.42 
 
 
361 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2481  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.17 
 
 
316 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.42 
 
 
343 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.67 
 
 
343 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.99 
 
 
346 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0385  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.1 
 
 
343 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.42 
 
 
361 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.88 
 
 
323 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.1 
 
 
343 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.42 
 
 
361 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.42 
 
 
361 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.1 
 
 
343 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0867  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.1 
 
 
343 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.1 
 
 
343 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.31 
 
 
320 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.18 
 
 
320 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.31 
 
 
320 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3965  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.88 
 
 
381 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.56 
 
 
323 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.63 
 
 
320 aa  414  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1829  aspartate carbamoyltransferase  62.81 
 
 
339 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.95 
 
 
320 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.81 
 
 
323 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1380  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.58 
 
 
320 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591528  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0910  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.59 
 
 
320 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.95 
 
 
323 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.816603  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3345  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.63 
 
 
320 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4614  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.67 
 
 
320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.67 
 
 
320 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352812 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.23 
 
 
327 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3890  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.17 
 
 
319 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3698  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.14 
 
 
319 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3059  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.23 
 
 
327 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0246  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.38 
 
 
326 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.906475  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0267  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.11 
 
 
322 aa  368  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.18 
 
 
362 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315008  hitchhiker  0.000272869 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0531  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.23 
 
 
357 aa  351  8.999999999999999e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0103229 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.91 
 
 
357 aa  350  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  56.44 
 
 
313 aa  338  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0942  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.73 
 
 
316 aa  335  9e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02002  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.41 
 
 
312 aa  331  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.26 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.84 
 
 
315 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.29 
 
 
313 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.84 
 
 
315 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.97 
 
 
313 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.52 
 
 
315 aa  322  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  56.03 
 
 
311 aa  321  8e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  53.52 
 
 
329 aa  321  8e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.97 
 
 
313 aa  321  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  52.29 
 
 
311 aa  320  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.57 
 
 
317 aa  319  5e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  54.92 
 
 
319 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  55.02 
 
 
313 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.57 
 
 
316 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.79 
 
 
316 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.24 
 
 
317 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.89 
 
 
334 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.23 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.92 
 
 
313 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.69 
 
 
318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.77 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.9 
 
 
316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.47 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  51.33 
 
 
312 aa  314  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.56 
 
 
362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  52.1 
 
 
312 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  52.4 
 
 
314 aa  311  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.49 
 
 
312 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3091  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.82 
 
 
316 aa  310  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559987  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  52.55 
 
 
313 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>