More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0935 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0935  glutathione synthetase  100 
 
 
314 aa  629  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.263345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  62.7 
 
 
314 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  57.65 
 
 
310 aa  348  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  56.91 
 
 
317 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  57.23 
 
 
317 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  56.31 
 
 
322 aa  345  7e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  54.87 
 
 
316 aa  345  8e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  52.27 
 
 
316 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  52.6 
 
 
318 aa  344  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  56.59 
 
 
317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  51.95 
 
 
316 aa  342  7e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  56.27 
 
 
317 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  58.98 
 
 
318 aa  339  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  52.55 
 
 
321 aa  339  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  55.16 
 
 
313 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  54.55 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  54.55 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  54.55 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  54.55 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  54.55 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  54.55 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  54.55 
 
 
315 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  54.55 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  57.97 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  52.27 
 
 
315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  52.6 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  52.6 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  52.6 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  54.05 
 
 
319 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  58.11 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  52.27 
 
 
315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  54.05 
 
 
319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  54.22 
 
 
316 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0892  glutathione synthetase  54.43 
 
 
314 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  54.34 
 
 
316 aa  335  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  52.27 
 
 
317 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1016  glutathione synthetase  54.43 
 
 
314 aa  335  7e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  51.95 
 
 
315 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  51.95 
 
 
315 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  53.72 
 
 
319 aa  334  9e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  51.95 
 
 
316 aa  335  9e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  55.63 
 
 
319 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  51.3 
 
 
328 aa  334  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  52.27 
 
 
317 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  53.57 
 
 
315 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  57.63 
 
 
317 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  53.57 
 
 
315 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  53.57 
 
 
315 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  52.27 
 
 
317 aa  332  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  53.57 
 
 
315 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  52.27 
 
 
315 aa  332  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  54.69 
 
 
317 aa  332  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  53.25 
 
 
315 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  54.98 
 
 
319 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  53.25 
 
 
315 aa  331  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  50.8 
 
 
329 aa  331  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  54.37 
 
 
319 aa  329  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  54.37 
 
 
319 aa  329  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  50.97 
 
 
316 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  54.19 
 
 
317 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  49.68 
 
 
320 aa  328  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  53.05 
 
 
317 aa  328  8e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  50.16 
 
 
315 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  51.3 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  50.97 
 
 
319 aa  325  7e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  53.07 
 
 
317 aa  325  9e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  52.92 
 
 
316 aa  323  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  52.23 
 
 
316 aa  322  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  49.52 
 
 
318 aa  319  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  54.66 
 
 
315 aa  316  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  49.2 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  49.2 
 
 
321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  49.84 
 
 
320 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0512  glutathione synthetase  51.47 
 
 
321 aa  310  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0057  glutathione synthase  52.13 
 
 
317 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0482  glutathione synthetase  46.77 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.580777  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  49.2 
 
 
324 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1810  glutathione synthetase  49.35 
 
 
319 aa  300  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  48.55 
 
 
323 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  48.55 
 
 
323 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1811  glutathione synthetase  48.71 
 
 
319 aa  299  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0574  glutathione synthetase  51.78 
 
 
318 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.918969  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  48.2 
 
 
325 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  48.23 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  47.08 
 
 
317 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  48.06 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0010  glutathione synthetase  47.47 
 
 
339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163572  normal  0.0543888 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  49.36 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  49.36 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2033  glutathione synthetase  48.06 
 
 
327 aa  281  8.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0294  glutathione synthetase  46.43 
 
 
317 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2409  glutathione synthase  48.38 
 
 
314 aa  275  8e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  46.62 
 
 
316 aa  269  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3256  glutathione synthetase  46.77 
 
 
316 aa  261  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0915852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3907  glutathione synthetase  46.77 
 
 
316 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0225291  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  44.59 
 
 
316 aa  258  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3909  glutathione synthetase  47.08 
 
 
315 aa  256  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  45.83 
 
 
318 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  46.13 
 
 
318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  44.16 
 
 
315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>