More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0875 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0875  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  100 
 
 
325 aa  633  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  37.97 
 
 
312 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  33.85 
 
 
320 aa  165  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  33.85 
 
 
321 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  29.91 
 
 
323 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  29.91 
 
 
323 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  35.96 
 
 
321 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  33.95 
 
 
321 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.09 
 
 
326 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  30.72 
 
 
320 aa  158  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  34.97 
 
 
320 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  35.44 
 
 
319 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5096  biotin--protein ligase  37.14 
 
 
317 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301513  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  35.44 
 
 
319 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  32.22 
 
 
328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  34.95 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.91 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  31.82 
 
 
319 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  33.44 
 
 
320 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  32.12 
 
 
319 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.08 
 
 
328 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  33.13 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  34.81 
 
 
335 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  31.52 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  30.84 
 
 
333 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  33.33 
 
 
319 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  32.39 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  35.76 
 
 
319 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  35.65 
 
 
319 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  32.81 
 
 
319 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.74 
 
 
329 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  32.81 
 
 
319 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  32.81 
 
 
319 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  34.09 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.88 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  32.51 
 
 
319 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  34.09 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  34.09 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  34.09 
 
 
321 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  34.09 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  34.09 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  34.09 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  34.09 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  34.81 
 
 
321 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  32.73 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  32.22 
 
 
317 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  29.74 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  32.42 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  32.42 
 
 
319 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.73 
 
 
322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0440  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.66 
 
 
336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.028543  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  33.22 
 
 
320 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  33.22 
 
 
320 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  33.22 
 
 
320 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  33.22 
 
 
320 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  33.22 
 
 
320 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  31.17 
 
 
319 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  31.79 
 
 
323 aa  142  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  31.25 
 
 
319 aa  142  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  34.06 
 
 
331 aa  142  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  29.7 
 
 
319 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  33.44 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0085  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.75 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00153974  normal  0.0550519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1903  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.08 
 
 
327 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.37759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.71 
 
 
328 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  30.91 
 
 
319 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  28.88 
 
 
320 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0233  biotin--protein ligase  36.36 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0654  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.79 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2320  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.35 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0571544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2191  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.63 
 
 
327 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0159  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.86 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  35.69 
 
 
293 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0177  biotin--protein ligase  32.42 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131379  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2840  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.37 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  33.53 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.28 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1463  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.38 
 
 
326 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0460  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.74 
 
 
331 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2427  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.77 
 
 
321 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1261  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.16 
 
 
326 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1704  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  32.06 
 
 
326 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1987  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.89 
 
 
338 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.417612  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  27.73 
 
 
331 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2459  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.33 
 
 
329 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1420  biotin operon repressor  31.75 
 
 
326 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1666  birA bifunctional protein  31.75 
 
 
326 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1447  birA bifunctional protein  31.75 
 
 
326 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.867427  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  28 
 
 
333 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1560  bifunctional biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  31.75 
 
 
326 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1631  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  31.75 
 
 
326 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.104533 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0500  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.12 
 
 
329 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1419  biotin operon repressor  31.75 
 
 
326 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2817  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.71 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1593  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  31.75 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1229  biotin--protein ligase  32.24 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1136  biotin--protein ligase  32.24 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2654  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.28 
 
 
343 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0086  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.54 
 
 
332 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0077  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.23 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>