91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0795 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0795  PilT protein-like protein  100 
 
 
95 aa  192  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  54.35 
 
 
133 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  50 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  47.83 
 
 
134 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2391  PIN (PilT N terminus) domain  48.31 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  48.42 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  48.91 
 
 
132 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1876  PilT protein domain protein  47.83 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2655  PIN domain protein  44.57 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2281  PilT protein domain protein  44.57 
 
 
113 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.913458  hitchhiker  0.0000308693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  44.57 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  50.55 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2597  PilT protein-like protein  46.74 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  45.65 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  42.7 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  45.65 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  46.07 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  45.65 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  46.39 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  46.81 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  45.74 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  40.86 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  42.11 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  38.71 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  42.86 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  42.39 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  43.01 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  45.26 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  43.01 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  40.22 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  36.56 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  36.96 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  46.07 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  41.05 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  46.15 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  43.62 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  39.78 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  36.96 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  42.86 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  37.63 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  45.05 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  42.22 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  38.04 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  45.05 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  42.39 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  40 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  42.11 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  36.67 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  39.58 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  41.76 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4600  putative nitrogen regulatory protein (NtrR-like), putative virulence associated protein (vap)  48.39 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.660475  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  45.59 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  42.22 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  37.78 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  40.45 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  40.22 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  37.89 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  50 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  37.89 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  35.48 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1681  PilT protein-like  56 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116331  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  42.86 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  37.36 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  39.13 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  39.13 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  40.82 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  33.68 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  37.23 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  40.43 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  40.43 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  48.98 
 
 
134 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2721  PilT protein-like protein  33.7 
 
 
125 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  37.36 
 
 
129 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1509  PilT domain-containing protein  36 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203613  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1566  PilT domain-containing protein  40.86 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123163  normal  0.225999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1545  PilT domain-containing protein  39.78 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.230093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4794  PilT protein-like  40.86 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  42.31 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0459  PilT protein domain protein  40 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.063195 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0151  PilT protein domain protein  31.91 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.85559  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0141  plasmid maintenance protein VagD  40.43 
 
 
138 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0017  PilT domain-containing protein  39.36 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.461831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0012  PilT protein domain-containing protein  34.44 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.948131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0234  PilT domain-containing protein  34.41 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  31.58 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  40.38 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  52.94 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1840  PilT domain-containing protein  26.53 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  34.44 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>