More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0773 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  100 
 
 
249 aa  507  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  53.23 
 
 
263 aa  292  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  41.77 
 
 
253 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  41.37 
 
 
253 aa  207  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  41.83 
 
 
253 aa  204  8e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  43.21 
 
 
237 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  39.59 
 
 
247 aa  187  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  36.44 
 
 
263 aa  178  8e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  36.07 
 
 
244 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  39.33 
 
 
253 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  38.15 
 
 
263 aa  144  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  35.27 
 
 
241 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  33.2 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.7 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  31.15 
 
 
561 aa  101  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.15 
 
 
561 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.15 
 
 
561 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.15 
 
 
561 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  29.13 
 
 
564 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.92 
 
 
562 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  30.74 
 
 
561 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.8 
 
 
568 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.1 
 
 
562 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  30.2 
 
 
562 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  27.65 
 
 
578 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  32.82 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  29.12 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.2 
 
 
545 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.57 
 
 
562 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.57 
 
 
562 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.57 
 
 
562 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.57 
 
 
562 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.57 
 
 
562 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.57 
 
 
562 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.57 
 
 
562 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  38.73 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.34 
 
 
581 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  30.83 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  38.81 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  27.34 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.73 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  32.32 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  26.21 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  27.27 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  24.48 
 
 
330 aa  78.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  36.89 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  36.89 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  32.46 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  40 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  30.74 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  58.46 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.3 
 
 
556 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  25.42 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  35.14 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  38.52 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  31.66 
 
 
254 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  58.93 
 
 
253 aa  72  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  29.88 
 
 
247 aa  72  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  26.97 
 
 
325 aa  72  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  51.61 
 
 
388 aa  72  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  51.67 
 
 
374 aa  72  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  31.16 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  31.3 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  52.63 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  31.92 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.66 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  31.66 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.39 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  34.38 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  31.54 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.31 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.19 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  35.19 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  41.41 
 
 
383 aa  68.6  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.13 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  55 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  39.81 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  35.57 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  30.5 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  30.5 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  26.09 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2073  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  36.55 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  30.5 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  30.5 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  30.5 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  26.44 
 
 
414 aa  67  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  30.5 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  51.67 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  51.67 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  30.5 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  30.5 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  25.66 
 
 
595 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  50.85 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3959  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  39.37 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  46.67 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  31.91 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  53.33 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  26.23 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>