94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0771 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0771  hypothetical protein  100 
 
 
1022 aa  2049    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1404  hypothetical protein  39.04 
 
 
990 aa  704    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.549738  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0660  hypothetical protein  33.12 
 
 
815 aa  502  1e-140  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.81909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5512  hypothetical protein  42.03 
 
 
771 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807443  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1751  hypothetical protein  35.13 
 
 
779 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1417  hypothetical protein  34.67 
 
 
779 aa  479  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.196003  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0314  hypothetical protein  34.95 
 
 
774 aa  479  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1630  hypothetical protein  34.23 
 
 
754 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3394  hypothetical protein  39.74 
 
 
795 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0014  hypothetical protein  38.95 
 
 
814 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661545 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29441  hypothetical protein  37.77 
 
 
693 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0729  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  41.19 
 
 
396 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7106  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  35.29 
 
 
414 aa  225  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7108  hypothetical protein  34.87 
 
 
358 aa  188  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0728  hypothetical protein  29.92 
 
 
389 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  29.24 
 
 
237 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  24.68 
 
 
244 aa  67  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  30.47 
 
 
956 aa  64.3  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  28.93 
 
 
865 aa  63.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  26.92 
 
 
256 aa  62.4  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  26.58 
 
 
241 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  31.47 
 
 
828 aa  62  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  23.14 
 
 
263 aa  60.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  26.3 
 
 
890 aa  57.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.38 
 
 
903 aa  58.2  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  25.27 
 
 
869 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  27.39 
 
 
249 aa  57.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.51 
 
 
561 aa  55.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  24.14 
 
 
868 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.51 
 
 
561 aa  55.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  25.09 
 
 
869 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  25.18 
 
 
874 aa  55.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.51 
 
 
561 aa  54.7  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  29.33 
 
 
842 aa  54.7  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  23.78 
 
 
868 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  26.51 
 
 
561 aa  54.7  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.51 
 
 
562 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.51 
 
 
561 aa  54.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.38 
 
 
568 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  24.57 
 
 
871 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.98 
 
 
562 aa  53.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  25.35 
 
 
866 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  25.09 
 
 
868 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  30.81 
 
 
791 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  25.27 
 
 
868 aa  53.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  22.98 
 
 
247 aa  52.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  25.27 
 
 
868 aa  53.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.13 
 
 
811 aa  52.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  27.94 
 
 
564 aa  52.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  30.63 
 
 
562 aa  52  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  23.74 
 
 
556 aa  51.6  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  24.91 
 
 
868 aa  51.2  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  25.31 
 
 
263 aa  51.2  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  24.38 
 
 
868 aa  51.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.96 
 
 
867 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.76 
 
 
562 aa  49.3  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  31.39 
 
 
868 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.76 
 
 
562 aa  49.3  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.76 
 
 
562 aa  49.3  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.76 
 
 
562 aa  49.3  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.76 
 
 
562 aa  49.3  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  23.73 
 
 
253 aa  49.3  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.76 
 
 
562 aa  49.3  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.76 
 
 
562 aa  49.3  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  22.59 
 
 
887 aa  48.9  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  28.98 
 
 
263 aa  48.9  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.75 
 
 
975 aa  48.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  24.73 
 
 
868 aa  48.5  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.24 
 
 
821 aa  48.5  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  48 
 
 
873 aa  48.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.68 
 
 
797 aa  48.1  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  45.76 
 
 
971 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35 
 
 
581 aa  47.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  27.37 
 
 
907 aa  47.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4026  PEP-utilising enzyme, mobile region  26.92 
 
 
537 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.756461  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.76 
 
 
950 aa  47.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  34 
 
 
578 aa  47.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.76 
 
 
971 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  33.89 
 
 
788 aa  47  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.97 
 
 
868 aa  46.2  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.55 
 
 
884 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  26.06 
 
 
886 aa  46.2  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  32.74 
 
 
814 aa  45.8  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  27.41 
 
 
887 aa  45.8  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2917  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.86 
 
 
692 aa  45.8  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  29.9 
 
 
884 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  23.61 
 
 
253 aa  45.4  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  29.41 
 
 
262 aa  45.8  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.05 
 
 
1240 aa  45.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  19.58 
 
 
247 aa  44.7  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  33.58 
 
 
842 aa  44.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  33.58 
 
 
842 aa  44.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.55 
 
 
971 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.15 
 
 
959 aa  44.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>