More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0711 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
222 aa  441  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.18 
 
 
226 aa  271  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  64.04 
 
 
222 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.2 
 
 
216 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.2 
 
 
222 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.24 
 
 
214 aa  259  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.46 
 
 
217 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.56 
 
 
216 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.46 
 
 
217 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.68 
 
 
215 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.98 
 
 
217 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1699  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.29 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  65.69 
 
 
217 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.45 
 
 
216 aa  241  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.77 
 
 
219 aa  239  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000873186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.45 
 
 
213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2113  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.86 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.05 
 
 
214 aa  232  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.54 
 
 
224 aa  230  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.33 
 
 
218 aa  230  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.77 
 
 
212 aa  229  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.49 
 
 
209 aa  229  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.77 
 
 
212 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.29 
 
 
222 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.77 
 
 
212 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.46 
 
 
212 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.35 
 
 
245 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.28 
 
 
220 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.98 
 
 
215 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.88 
 
 
219 aa  228  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60 
 
 
221 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.96 
 
 
212 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2696  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.96 
 
 
212 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.46 
 
 
212 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.71 
 
 
213 aa  226  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.77 
 
 
213 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.1 
 
 
220 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.8 
 
 
223 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.1 
 
 
220 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.47 
 
 
212 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.96 
 
 
212 aa  225  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3525  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.44 
 
 
212 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0302516  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60.11 
 
 
220 aa  225  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.96 
 
 
212 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.96 
 
 
212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.96 
 
 
212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.96 
 
 
212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  53.96 
 
 
212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.96 
 
 
212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.96 
 
 
212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.76 
 
 
216 aa  224  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.02 
 
 
219 aa  223  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.85 
 
 
220 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.47 
 
 
219 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.92 
 
 
216 aa  222  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.84 
 
 
217 aa  222  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.47 
 
 
212 aa  222  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.07 
 
 
212 aa  222  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.12 
 
 
220 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.61 
 
 
220 aa  221  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.84 
 
 
210 aa  221  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.38 
 
 
218 aa  221  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.1 
 
 
209 aa  221  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.81 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.85 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.85 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.8 
 
 
220 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.9 
 
 
212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.84 
 
 
221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1068  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.8 
 
 
220 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.74 
 
 
212 aa  218  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.89 
 
 
220 aa  218  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.72 
 
 
212 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2098  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.94 
 
 
212 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.67 
 
 
218 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.24 
 
 
217 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.69 
 
 
214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00170053  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.87 
 
 
216 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.48 
 
 
204 aa  214  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1456  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.53 
 
 
209 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.551821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.63 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0668688  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.41 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.89 
 
 
214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.53 
 
 
224 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.04 
 
 
204 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.5 
 
 
214 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1512  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.72 
 
 
214 aa  209  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374503  normal  0.459598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.98 
 
 
206 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2745  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.24 
 
 
214 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000377179  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.22 
 
 
216 aa  206  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.04 
 
 
220 aa  205  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5165  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.42 
 
 
218 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820799  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.24 
 
 
194 aa  204  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.74 
 
 
203 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2095  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.5 
 
 
213 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000370583  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03201  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.75 
 
 
212 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.54 
 
 
211 aa  202  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.72 
 
 
214 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.72 
 
 
214 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.72 
 
 
214 aa  202  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>