123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0588 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0588  redox-active disulfide protein 2  100 
 
 
77 aa  156  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3775  redox-active disulfide protein 2  54.55 
 
 
78 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0535  redox-active disulfide protein 2  51.95 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3496  redox-active disulfide protein 2  51.95 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3831  redox-active disulfide protein 2  53.25 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3957  redox-active disulfide protein 2  53.25 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3356  redox-active disulfide protein 2  55.84 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1222  redox-active disulfide protein 2  56.58 
 
 
78 aa  93.6  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1829  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  55.84 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813005  normal  0.88262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0536  redox-active disulfide protein 2  50.65 
 
 
78 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0493  redox-active disulfide protein 2  51.95 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1811  redox-active disulfide protein 2  55.26 
 
 
76 aa  90.5  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3817  redox-active disulfide protein 2  55.26 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4599  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  53.25 
 
 
78 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81041  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2332  redox-active disulfide protein 2  53.95 
 
 
78 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.650672  normal  0.0752191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3416  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  49.35 
 
 
78 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369553  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1429  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  50 
 
 
77 aa  81.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3191  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  48.68 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4203  putative glutaredoxin family protein/Thio-disulfide isomerase  54.05 
 
 
76 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1726  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  51.32 
 
 
76 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1869  hypothetical protein  45.95 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0111  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  48.05 
 
 
77 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2948  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  41.56 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.960362  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1934  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  44.74 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3420  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  43.42 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1646  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  44.74 
 
 
77 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3336  redox-active disulfide protein 2  45.45 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0399  redox-active disulfide protein 2  48.68 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3943  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  42.11 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4075  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  44.16 
 
 
78 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1475  redox-active disulfide protein 2  46.05 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2554  redox-active disulfide protein 2  52.7 
 
 
80 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000309431  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2641  redox-active disulfide protein 2  47.3 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3642  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  42.47 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2843  glutaredoxin  43.84 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.486982  hitchhiker  0.00945074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3619  redox-active disulfide protein 2  41.56 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0155  hypothetical protein  39.19 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0462  redox-active disulfide protein 2  44.74 
 
 
78 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000236165  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2025  redox-active disulfide protein 2  41.56 
 
 
78 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0702  redox-active disulfide protein 2  41.89 
 
 
77 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.94898 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0943  redox-active disulfide protein 2  38.36 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0487  redox-active disulfide protein 2  41.1 
 
 
82 aa  67  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1710  hypothetical protein  42.47 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0068017  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0894  redox-active disulfide protein 2  43.48 
 
 
80 aa  67  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1007  redox-active disulfide protein 2  41.1 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00309602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3598  redox-active disulfide protein 2  39.73 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.420898 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0827  redox-active disulfide protein 2  43.59 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000837608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2564  redox-active disulfide protein 2  41.1 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000509192  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1205  redox-active disulfide protein 2  40.54 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_878  redox-active disulfide protein 2  42.03 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.895707  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1856  redox-active disulfide protein 2  41.56 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227349  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0176  redox-active disulfide protein 2  38.36 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1221  redox-active disulfide protein 2  43.24 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20080  redox-active disulfide protein 2  40.26 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0018  redox-active disulfide protein 2  44.59 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1300  redox-active disulfide protein 2  41.1 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0856  redox-active disulfide protein 2  41.1 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1705  redox-active disulfide protein 2  37.66 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3648  redox-active disulfide protein 2  45.95 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0508  redox-active disulfide protein 2  38.16 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1877  redox-active disulfide protein 2  43.24 
 
 
76 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1708  redox-active disulfide protein 2  32.89 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0185  putative thioredoxin  38.16 
 
 
77 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3674  redox-active disulfide protein 2  38.96 
 
 
78 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.766727  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1028  redox-active disulfide protein 2  42.47 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1090  redox-active disulfide protein 2  42.47 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3660  redox-active disulfide protein 2  45.33 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1903  redox-active disulfide protein 2  39.73 
 
 
77 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.76321  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1211  redox-active disulfide protein 2  44.59 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2956  redox-active disulfide protein 2  42.47 
 
 
78 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1116  redox-active disulfide protein 2  38.16 
 
 
77 aa  60.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1624  redox-active disulfide protein 2  38.36 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000124454  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2350  redox-active disulfide protein 2  43.24 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.4313  hitchhiker  0.00041608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0546  redox-active disulfide protein 2  39.19 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3835  redox-active disulfide protein 2  43.24 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0586  redox-active disulfide protein 2  37.84 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1749  redox-active disulfide protein 2  35.53 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0327584  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1324  redox-active disulfide protein 2  38.16 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5315  redox-active disulfide protein 2  38.36 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31849  normal  0.0964369 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0815  hypothetical protein  35.53 
 
 
78 aa  58.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.817572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1184  redox-active disulfide protein 2  38.36 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1067  redox-active disulfide protein 2  37.84 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0264  redox-active disulfide protein 2  39.44 
 
 
73 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1907  redox-active disulfide protein 2  36.84 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0881518  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1803  redox-active disulfide protein 2  36.84 
 
 
80 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0818  redox-active disulfide protein 2  38.96 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519826  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1782  redox-active disulfide protein 2  38.36 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.889289  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4282  redox-active disulfide protein 2  39.19 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1285  redox-active disulfide protein 2  33.78 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.539876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2180  redox-active disulfide protein 2  40.58 
 
 
75 aa  57.4  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000368742  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2567  redox-active disulfide protein 2  36.84 
 
 
80 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0518  redox-active disulfide protein 2  41.1 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1484  redox-active disulfide protein 2  33.78 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.591966  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0750  redox-active disulfide protein 2  40.26 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0730  redox-active disulfide protein 2  37.33 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000429418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4061  redox-active disulfide protein 2  35.06 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal  0.892222 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1093  hypothetical protein  37.33 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000000590144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0019  redox-active disulfide protein 2  35.53 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.753681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1322  redox-active disulfide protein 2  36.49 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0752  redox-active disulfide protein 2  35.14 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0355259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>