More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0536 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
416 aa  840  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.11 
 
 
421 aa  531  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.25 
 
 
429 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.25 
 
 
429 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  57.82 
 
 
420 aa  493  1e-138  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.51 
 
 
429 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  56.04 
 
 
414 aa  484  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  52.38 
 
 
425 aa  482  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.07 
 
 
429 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.65 
 
 
417 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.21 
 
 
425 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.75 
 
 
451 aa  466  1e-130  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.14 
 
 
427 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  53.25 
 
 
405 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.09 
 
 
414 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  53 
 
 
405 aa  461  1e-128  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.73 
 
 
412 aa  458  1e-128  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  3.85676e-08  unclonable  1.52095e-15 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.71 
 
 
404 aa  460  1e-128  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.26 
 
 
415 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 
408 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.51 
 
 
418 aa  454  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.1 
 
 
414 aa  454  1e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.96 
 
 
406 aa  446  1e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.85 
 
 
406 aa  445  1e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  2.83455e-05 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  51.92 
 
 
429 aa  446  1e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  52.36 
 
 
414 aa  446  1e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
404 aa  447  1e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.09 
 
 
413 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  52.97 
 
 
406 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  53.22 
 
 
406 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  5.7861e-05 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.38 
 
 
404 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.61 
 
 
406 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.85 
 
 
406 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.2 
 
 
419 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.97 
 
 
406 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  6.02764e-07 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  51.86 
 
 
414 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  52.97 
 
 
406 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.72 
 
 
406 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.54851e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.97 
 
 
406 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.72 
 
 
406 aa  441  1e-122  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  1.07568e-08 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  51.24 
 
 
404 aa  441  1e-122  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  52.17 
 
 
421 aa  441  1e-122  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.48 
 
 
415 aa  438  1e-122  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  52.17 
 
 
414 aa  441  1e-122  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.61 
 
 
407 aa  440  1e-122  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  52.17 
 
 
414 aa  440  1e-122  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.61 
 
 
406 aa  441  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04018e-08 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.74 
 
 
406 aa  438  1e-122  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.61 
 
 
406 aa  441  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  7.97081e-10 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  50.74 
 
 
415 aa  439  1e-122  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.36 
 
 
407 aa  439  1e-122  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.61 
 
 
406 aa  441  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  7.37026e-08 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.69 
 
 
415 aa  441  1e-122  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.72 
 
 
406 aa  441  1e-122  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.74 
 
 
413 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.74 
 
 
413 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  53.1 
 
 
406 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  2.89207e-05 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  51.24 
 
 
413 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.24 
 
 
413 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.72 
 
 
415 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  51.34 
 
 
422 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
428 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  49.88 
 
 
416 aa  431  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.21 
 
 
412 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.74 
 
 
420 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.63 
 
 
657 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.59 
 
 
418 aa  431  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.91 
 
 
413 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
416 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  51.98 
 
 
416 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.48 
 
 
441 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.81 
 
 
414 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.61 
 
 
418 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.25 
 
 
673 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.25 
 
 
672 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.61 
 
 
418 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.29 
 
 
442 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.25 
 
 
674 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.93 
 
 
444 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  48.91 
 
 
414 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.11 
 
 
414 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.56 
 
 
414 aa  430  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.75 
 
 
664 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  7.69952e-06 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.86 
 
 
413 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.15 
 
 
413 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.64 
 
 
414 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.62 
 
 
406 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
434 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.25 
 
 
405 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  1.39909e-10 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  50.12 
 
 
604 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  50.12 
 
 
414 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  50.12 
 
 
604 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.61 
 
 
413 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
626 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.97 
 
 
406 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.61 
 
 
417 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.11 
 
 
426 aa  421  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.26 
 
 
621 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  50.37 
 
 
417 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.73 
 
 
416 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>