More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0522 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  100 
 
 
311 aa  630  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  63.19 
 
 
312 aa  394  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  53.57 
 
 
310 aa  342  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  54.19 
 
 
309 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  49.68 
 
 
306 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  53.35 
 
 
309 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  53.35 
 
 
309 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  49.68 
 
 
306 aa  324  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  50.32 
 
 
306 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  53.04 
 
 
309 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
306 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  49.68 
 
 
306 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
306 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  49.35 
 
 
306 aa  322  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  49.35 
 
 
306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  49.35 
 
 
306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  49.35 
 
 
306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  49.35 
 
 
306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  51.17 
 
 
309 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  52.92 
 
 
310 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  49.35 
 
 
306 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  52.6 
 
 
310 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  50.97 
 
 
308 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  50.97 
 
 
308 aa  315  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  50.16 
 
 
316 aa  315  6e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  49.35 
 
 
306 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  51.82 
 
 
310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  50.16 
 
 
313 aa  311  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  48.38 
 
 
306 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  50.49 
 
 
311 aa  311  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  50.32 
 
 
309 aa  308  8e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  47.73 
 
 
306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  52.92 
 
 
310 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  46.75 
 
 
307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  49.84 
 
 
308 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  48.22 
 
 
308 aa  305  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  49.51 
 
 
308 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  47.1 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  48.53 
 
 
310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  48.56 
 
 
311 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  48.56 
 
 
311 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  47.57 
 
 
308 aa  299  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  48.24 
 
 
311 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  49.33 
 
 
306 aa  298  6e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  48.24 
 
 
311 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  50.82 
 
 
309 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  47.35 
 
 
306 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  45.28 
 
 
311 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  46.79 
 
 
338 aa  287  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  43.45 
 
 
314 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  45.54 
 
 
312 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  48.38 
 
 
314 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  48.38 
 
 
314 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  48.37 
 
 
314 aa  279  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  44.3 
 
 
314 aa  278  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  43.99 
 
 
314 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  44.69 
 
 
317 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  43.99 
 
 
314 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  43.59 
 
 
314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  43.59 
 
 
314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  47.63 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  43.59 
 
 
314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  43.59 
 
 
314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  43.59 
 
 
314 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  43.81 
 
 
314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  42.95 
 
 
313 aa  271  9e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  42.86 
 
 
314 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  43.63 
 
 
317 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  42.99 
 
 
313 aa  258  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  41.14 
 
 
313 aa  259  6e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  46.62 
 
 
309 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  41.21 
 
 
313 aa  256  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  46.98 
 
 
307 aa  255  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  40.58 
 
 
319 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  45.05 
 
 
314 aa  249  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  46.69 
 
 
248 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  38.16 
 
 
314 aa  209  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  39.07 
 
 
299 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  39.25 
 
 
322 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  38.78 
 
 
299 aa  206  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  38.3 
 
 
308 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  38.23 
 
 
299 aa  205  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  38.43 
 
 
295 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  37.76 
 
 
299 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  37.76 
 
 
299 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  38.36 
 
 
299 aa  203  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  40.07 
 
 
297 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  38.66 
 
 
312 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  38.58 
 
 
320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  39.22 
 
 
314 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  39.3 
 
 
322 aa  199  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  37.9 
 
 
317 aa  198  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  39.22 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  37.2 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  39.62 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  37.2 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  36.86 
 
 
299 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  36.99 
 
 
298 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  36.99 
 
 
298 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  36.99 
 
 
298 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>