More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0517 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  100 
 
 
418 aa  838    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  49.21 
 
 
430 aa  418  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  46.01 
 
 
408 aa  335  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  42.38 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  40.55 
 
 
425 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  39.41 
 
 
438 aa  309  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  43.36 
 
 
407 aa  308  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  42.28 
 
 
407 aa  305  7e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  42.28 
 
 
407 aa  305  7e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  39.9 
 
 
420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  39.95 
 
 
418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  39.72 
 
 
425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  38.1 
 
 
401 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  38.13 
 
 
383 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  35.97 
 
 
443 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  37.08 
 
 
405 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  38.53 
 
 
453 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  37.16 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.33 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  35.83 
 
 
410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  38.61 
 
 
453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  38.42 
 
 
406 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  38 
 
 
402 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  38 
 
 
402 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.91 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  38.1 
 
 
453 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  38.1 
 
 
453 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  36.49 
 
 
437 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  38.1 
 
 
453 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  37.96 
 
 
453 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  38.21 
 
 
453 aa  269  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  37.9 
 
 
459 aa  269  7e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  35.39 
 
 
401 aa  269  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  38.21 
 
 
453 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  38.9 
 
 
453 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  38.68 
 
 
404 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  35.59 
 
 
442 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  37.88 
 
 
453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  36.67 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  36.32 
 
 
451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  37.91 
 
 
454 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  34.19 
 
 
462 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  37.23 
 
 
455 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  37.66 
 
 
453 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  37.1 
 
 
460 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  38.56 
 
 
453 aa  262  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  34.89 
 
 
442 aa  262  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  35.71 
 
 
399 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  36.47 
 
 
400 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  33.76 
 
 
462 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  36.6 
 
 
398 aa  259  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  34.99 
 
 
441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.23 
 
 
400 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  37.8 
 
 
458 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  36.58 
 
 
405 aa  257  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  35.35 
 
 
440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  35.8 
 
 
402 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  36.21 
 
 
461 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.83 
 
 
426 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  37.18 
 
 
407 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  34.44 
 
 
402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  34.44 
 
 
402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  36.49 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  36.26 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  34.4 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  34.75 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  35.76 
 
 
402 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  34.36 
 
 
401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  33.97 
 
 
402 aa  243  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  36.02 
 
 
395 aa  242  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  35.55 
 
 
402 aa  242  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  33.89 
 
 
402 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  35.63 
 
 
399 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  33.8 
 
 
414 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  33.8 
 
 
414 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  35.35 
 
 
413 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  33.8 
 
 
414 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  33.96 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 
403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 
403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 
437 aa  239  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  34.28 
 
 
413 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 
403 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  35.44 
 
 
423 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 
403 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 
403 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.44 
 
 
423 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.15 
 
 
423 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  33.81 
 
 
413 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  33.11 
 
 
440 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  34.91 
 
 
414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  37.95 
 
 
395 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  33.81 
 
 
413 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  33.81 
 
 
413 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  33.94 
 
 
428 aa  235  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  33.94 
 
 
428 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  33.94 
 
 
428 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  33.81 
 
 
413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1789  flagellar hook protein FlgE  35.15 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>