80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0441 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.67 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  44.95 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.46 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.6 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  35.64 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.14 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.04 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  32.08 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.82 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.25 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.76 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.12 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.07 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.08 
 
 		 105 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4689  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.34 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.36 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.89 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.36 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.96 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  37.84 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  28.23 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.98 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.84 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.84 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1341  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.06 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000011697  hitchhiker  0.000659538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.98 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.98 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.66 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  42.37 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  37.35 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4714  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.63 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.991534  normal  0.729946 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  28.12 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.25 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  31.25 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  40.98 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3414  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.55 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  hitchhiker  0.00103073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  42.86 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  27.91 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.58 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.3 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.29 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  32.53 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.67 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.67 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  26.67 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.85 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  28.71 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.48 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.58 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2842  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.31 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00137778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.93 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.28 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  26.51 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.21 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.21 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  25.3 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0766  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.67 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.69 
 
 		 112 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6382  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.1 
 
 		 589 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6044  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.58 
 
 		 116 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.304642 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2204  BphA  29.09 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322036  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6347  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.48 
 
 		 516 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000113528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1152  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.47 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6790  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.14 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.215652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2575  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.47 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3053  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.47 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0965485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2686  H-NS histone family protein  31.11 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.47 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1386  H-NS histone family protein  31.11 
 
 		 93 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1784  H-NS histone family protein  31.11 
 
 		 93 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0489  H-NS histone family protein  31.11 
 
 		 93 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1601  putative DNA-binding protein  31.11 
 
 		 93 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1623  H-NS histone family protein  31.11 
 
 		 93 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0668  H-NS histone family protein  31.11 
 
 		 93 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0958724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0864  H-NS histone family protein  31.11 
 
 		 93 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>