More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0428 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0767  translation initiation factor 3  79.45 
 
 		 146 aa  232  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  66.88 
 
 		 159 aa  220  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  66.23 
 
 		 163 aa  213  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 180 aa  210  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  63.46 
 
 		 178 aa  207  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  63.46 
 
 		 178 aa  207  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  61.04 
 
 		 155 aa  206  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 178 aa  206  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  60.9 
 
 		 183 aa  206  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  60.9 
 
 		 183 aa  206  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  60.9 
 
 		 183 aa  206  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  60.9 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  61.69 
 
 		 190 aa  206  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  63.64 
 
 		 154 aa  206  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  62.82 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  62.18 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2098  translation initiation factor IF-3  65.97 
 
 		 147 aa  204  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2019  translation initiation factor IF-3  65.28 
 
 		 147 aa  204  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  62.99 
 
 		 184 aa  204  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 172 aa  202  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  60.9 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  61.04 
 
 		 173 aa  202  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  60.26 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 177 aa  200  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  59.62 
 
 		 156 aa  199  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  63.51 
 
 		 153 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2379  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 177 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0845211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 177 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000118732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  61.54 
 
 		 177 aa  197  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  61.18 
 
 		 202 aa  197  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  62.82 
 
 		 177 aa  197  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  62.18 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  62.18 
 
 		 177 aa  196  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  58.71 
 
 		 182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  61.78 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  56.41 
 
 		 172 aa  193  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  60.26 
 
 		 173 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  55.48 
 
 		 171 aa  191  2e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  57.42 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  61.04 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  56.77 
 
 		 194 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  56.77 
 
 		 194 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  56.41 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  57.42 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  55.77 
 
 		 179 aa  188  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  56.41 
 
 		 174 aa  187  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  56.86 
 
 		 173 aa  186  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  54.61 
 
 		 173 aa  186  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  55.13 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  53.95 
 
 		 238 aa  185  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1871  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 181 aa  184  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 171 aa  184  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  59.35 
 
 		 180 aa  184  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0913  translation initiation factor IF-3  66.88 
 
 		 172 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 		 174 aa  183  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1009  translation initiation factor IF-3  61.78 
 
 		 169 aa  183  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  63.43 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  52.56 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 		 225 aa  182  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  59.35 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  59.35 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  59.35 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  59.35 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  55.92 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  58.71 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  58.71 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2498  translation initiation factor IF-3  64.71 
 
 		 154 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00683377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  54.61 
 
 		 182 aa  181  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 219 aa  180  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1141  initiation factor 3  65.13 
 
 		 152 aa  180  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  58.17 
 
 		 173 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1887  translation initiation factor 3  55.77 
 
 		 160 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729735  normal  0.011077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2399  translation initiation factor 3  56.41 
 
 		 205 aa  179  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1449  translation initiation factor IF-3  56.41 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  52.29 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  51.3 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 198 aa  179  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2596  translation initiation factor IF-3  59.62 
 
 		 177 aa  178  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000880416  hitchhiker  0.000575086 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>