More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0392 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 
305 aa  611  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  52.22 
 
 
304 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  50.84 
 
 
297 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  47.44 
 
 
308 aa  205  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  35.08 
 
 
301 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  39.67 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  37.75 
 
 
303 aa  178  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  39.81 
 
 
311 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  40.65 
 
 
299 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  36.04 
 
 
310 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  39.48 
 
 
311 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  39.81 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  36.57 
 
 
301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  37.05 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  39.5 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  36.88 
 
 
302 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  38.29 
 
 
300 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  41.38 
 
 
309 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  40.62 
 
 
313 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  38.19 
 
 
298 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  37.82 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  34.7 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  35.08 
 
 
305 aa  162  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  40.45 
 
 
310 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  37.86 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  37.86 
 
 
300 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  38.64 
 
 
300 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  39.33 
 
 
302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  32.11 
 
 
346 aa  141  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  38.44 
 
 
307 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  26.85 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  30.99 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  33.55 
 
 
295 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  31.19 
 
 
316 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  32.8 
 
 
319 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  31.82 
 
 
315 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  31.53 
 
 
310 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  30.77 
 
 
313 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  31.19 
 
 
325 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  30.55 
 
 
312 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  28.62 
 
 
804 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  31.02 
 
 
287 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  29.32 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  32 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.59 
 
 
605 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  30.07 
 
 
807 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.56 
 
 
604 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.537957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  34.48 
 
 
605 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  27.13 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.77 
 
 
609 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  25.78 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.91 
 
 
605 aa  89  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  31.62 
 
 
818 aa  89  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  26.19 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  28.33 
 
 
768 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  27.99 
 
 
768 aa  86.3  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  29 
 
 
1227 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  29.93 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  27.27 
 
 
629 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  28.7 
 
 
1227 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  23.1 
 
 
774 aa  82.4  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  28.52 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  30.74 
 
 
804 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  28.4 
 
 
1263 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  27.93 
 
 
1228 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  30.33 
 
 
806 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  25.41 
 
 
841 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.76 
 
 
615 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1861  homocysteine S-methyltransferase  25.5 
 
 
434 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0415  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.92 
 
 
613 aa  79.3  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0405  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.92 
 
 
613 aa  79.3  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  27.57 
 
 
800 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  28.66 
 
 
1249 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.32 
 
 
610 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  26.24 
 
 
1226 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  27.85 
 
 
578 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  26.32 
 
 
780 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  28.05 
 
 
1228 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  29.36 
 
 
1251 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  28.87 
 
 
841 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  25.23 
 
 
316 aa  77  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  24.75 
 
 
791 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  29.29 
 
 
811 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  26.05 
 
 
1227 aa  76.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  28.67 
 
 
839 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.65 
 
 
610 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  26.61 
 
 
1227 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.73 
 
 
1226 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  27.33 
 
 
1226 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  28.2 
 
 
813 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  27.11 
 
 
1227 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  26.59 
 
 
1238 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  29.83 
 
 
801 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  26.84 
 
 
1225 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  29.89 
 
 
1250 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.21 
 
 
617 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  30.54 
 
 
804 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3617  methionine synthase (B12-dependent)  27.57 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732066  normal  0.0126884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  28.18 
 
 
1243 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4784  homocysteine S-methyltransferase  29.27 
 
 
643 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>