More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0350 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 
711 aa  1415  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  45.52 
 
 
708 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.05 
 
 
714 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.05 
 
 
714 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.99 
 
 
714 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  41.05 
 
 
721 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.67 
 
 
714 aa  479  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  38.15 
 
 
714 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.15 
 
 
714 aa  472  1e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.65 
 
 
714 aa  472  1e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.51 
 
 
714 aa  469  1e-130  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.51 
 
 
714 aa  469  1e-130  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  8.38668e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.51 
 
 
714 aa  469  1e-130  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.68 
 
 
714 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.19 
 
 
707 aa  453  1e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  7.14427e-07 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.97 
 
 
690 aa  454  1e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.97 
 
 
690 aa  453  1e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.97 
 
 
690 aa  453  1e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  3.22681e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.57 
 
 
690 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.43 
 
 
690 aa  447  1e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.43 
 
 
690 aa  446  1e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.43 
 
 
690 aa  446  1e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.43 
 
 
690 aa  446  1e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.27 
 
 
690 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.79 
 
 
690 aa  440  1e-122  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.81 
 
 
720 aa  440  1e-122  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.55 
 
 
692 aa  442  1e-122  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  4.11022e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.24 
 
 
692 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.20367e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.51 
 
 
691 aa  433  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.99 
 
 
712 aa  436  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.82 
 
 
690 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.39 
 
 
691 aa  432  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  35.23 
 
 
691 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.45 
 
 
691 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.09 
 
 
691 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.1 
 
 
725 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.18 
 
 
694 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.33 
 
 
686 aa  425  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.64 
 
 
703 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.07544e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.41 
 
 
700 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.91 
 
 
710 aa  386  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.54 
 
 
699 aa  360  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.4 
 
 
725 aa  354  3e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.38 
 
 
699 aa  353  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.69 
 
 
758 aa  346  8e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.84 
 
 
714 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.84 
 
 
714 aa  344  3e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.88 
 
 
729 aa  344  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.84 
 
 
714 aa  344  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.77 
 
 
715 aa  343  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.24 
 
 
732 aa  343  6e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.7 
 
 
714 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.7 
 
 
714 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.37 
 
 
762 aa  334  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.82 
 
 
726 aa  334  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.82 
 
 
726 aa  333  4e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.82 
 
 
726 aa  334  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.23 
 
 
716 aa  332  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.23 
 
 
716 aa  332  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.23 
 
 
716 aa  332  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  34.23 
 
 
716 aa  332  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  34.23 
 
 
716 aa  332  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.29 
 
 
716 aa  332  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  34.23 
 
 
716 aa  332  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.8 
 
 
716 aa  331  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.8 
 
 
716 aa  331  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.32 
 
 
692 aa  329  1e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.84 
 
 
738 aa  328  2e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.19 
 
 
701 aa  327  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.69 
 
 
741 aa  322  1e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  32.83 
 
 
750 aa  312  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  32.92 
 
 
664 aa  280  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  30.87 
 
 
876 aa  257  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  31.87 
 
 
840 aa  254  5e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  29.97 
 
 
851 aa  242  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.66591e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  28.3 
 
 
636 aa  241  3e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  29.54 
 
 
843 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.77416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  24.45 
 
 
832 aa  236  1e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  33.43 
 
 
664 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  30.14 
 
 
843 aa  234  4e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  25.28 
 
 
822 aa  232  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  27.32 
 
 
647 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  30.74 
 
 
729 aa  231  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  27.04 
 
 
662 aa  230  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  29.16 
 
 
830 aa  230  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  31.52 
 
 
640 aa  227  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  31.68 
 
 
643 aa  224  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  29.34 
 
 
754 aa  223  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  32.14 
 
 
838 aa  223  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  29.06 
 
 
658 aa  221  4e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.03 
 
 
930 aa  220  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.16 
 
 
957 aa  220  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  29.97 
 
 
652 aa  220  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  27.23 
 
 
645 aa  220  8e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  30.51 
 
 
713 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  28.84 
 
 
651 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  32.23 
 
 
681 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  30.34 
 
 
660 aa  218  3e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  24.72 
 
 
667 aa  218  4e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.59 
 
 
934 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  6.49538e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>