More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0324 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  65.05 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  40.46 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  60.47 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  39.36 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  47.83 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  53.19 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  59.09 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  32.86 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  49.09 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  53.7 
 
 		 229 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  36.11 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  49.06 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  35.78 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  36.59 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  31.58 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  50 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  34 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  52.5 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  32.04 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  49.06 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  37.31 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  49.06 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  46.43 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  43.75 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  49.06 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  46.58 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  36.14 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  31.58 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  46.58 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  40.68 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  44.64 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  40.91 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  30.56 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  51.85 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  49.06 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  49.06 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  49.06 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  45.1 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  29.92 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  29.71 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  58.54 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  50.94 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  50.94 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  34.55 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  46.3 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  56.76 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  38.46 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  36.71 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  56.1 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  45.28 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  39.74 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  46.81 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  50 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  31.58 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  39.39 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  46.34 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  46.15 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  54.05 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  43.64 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  53.49 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  55 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  43.64 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  60.98 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  28.87 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  56.1 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  50 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  50 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1030  hypothetical protein  45.24 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.163763 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  43.64 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  48.94 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  44.44 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  51.22 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  52.27 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  56.1 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  60.98 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  47.27 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  47.17 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  58.33 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  44.68 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  47.06 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0367  N-terminal methylation  41.94 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  41.82 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  48.89 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  63.89 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  48.84 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  51.16 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  46.94 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  47.17 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  32.28 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  47.92 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  58.54 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  48.78 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  43.64 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  43.33 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  46.51 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  43.64 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  42 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>